Il s'agit de l'application Linux nommée Drug Extraction à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom DrugExtractionStandalone.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Drug Extraction pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Extraction de médicaments à exécuter sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Reconnaissance des noms de médicaments et normalisation/mise à la terre des identifiants et des noms standard de DrugBank.Le paquet fournit 2 tagueurs :
1. DrugTagger - Basé sur CRF avec fonction de présence DrugBank (voir l'ensemble de fonctionnalités pour plus de détails).
2. DrugnameGazetteer - index géographique/dictionnaire. Dictionnaire créé à partir de la base de données DrugBank.ca.
Les deux marqueurs incluent la mise à la terre/la normalisation aux identifiants DrugBank et aux noms standard.
Jeu de fonctionnalités:
Mot, Mot-1, Mot+1, Mot-1_Mot, Mot_Mot+1, DrugBankPresence, POS
La fonction DrugBankPresence indique la présence du nom du médicament dans la DrugBank.
Utilisation de l'évaluation CONLL :
traité 32065 jetons avec 3656 phrases ; trouvé : 3251 expressions ; correct : 2786.
précision : 95.25 % ; précision : 85.70 % ; rappel : 76.20 % ; FB1 : 80.67
Utilisation de GATE Corpus Benchmark :
Strict : P : 0.65 R : 0.73 F1 : 0.69
Clémence : P : 0.74 R : 0.84 F1 : 0.78
Les détails sur la façon de reproduire l'évaluation, voir README.
Pour utiliser la version autonome pour le marquage, téléchargez DrugExtractionStandalone.tar.gz à partir de Fichiers.
Interface utilisateur
Console/Terminal
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/drug-extraction/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
