Il s'agit de l'application Linux nommée HyLiTE à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom HyLiTE-2.0.1-py3-none-any.whl. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée HyLiTE pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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HyLiTE pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
HyLiTE (Hybrid Lineage Transcriptome Explorer) analyse les données de transcriptome à haut débit d'espèces allopolyploïdes.L'allopolyploïdie décrit la formation d'un nouvel organisme hybride à partir de l'union de deux ou plusieurs parents différents. Les espèces allopolyploïdes portent de multiples copies de chaque gène (homéologues), qui présentent souvent des modèles d'expression inhabituels. Les niveaux d'expression des homéologues peuvent techniquement être déterminés à partir des données de séquençage de nouvelle génération (RNA-seq), mais en pratique, attribuer des lectures à un homéologue plutôt qu'à un autre est extrêmement difficile, en particulier à l'échelle du génome entier. HyLiTE automatise ce processus et permet d'explorer les modèles d'expression génique même chez des espèces allopolyploïdes très complexes.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Python
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/hylite/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
