Il s'agit de l'application Linux nommée MIRA dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom mira-4.0.2.tar.bz2. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MIRA avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
MIRA
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DESCRIPTION
MIRA - Assembleur de séquences et cartographie de séquences pour le fusil de chasse du génome entier et les données de séquençage EST / RNASeq. Peut utiliser les données Sanger, 454, Illumina et IonTorrent. PacBio : CCS et données corrigées utilisables, non corrigées pas encore.
Fonctionnalités
- Permet des assemblages hybrides de données Sanger, 454, Solexa, IonTorrent et PacBio (CCS & ecCLR)
- Peut utiliser des données appariées et/ou non appariées
- Prend en charge les données auxiliaires au format TRACEINFO (de NCBI)
- Marque les points d'intérêt avec des tags afin qu'ils puissent être trouvés rapidement dans les programmes de finition
- Possède un pipeline d'analyse SNP pour le séquençage des données de virus et de procaryontes
Audience
Utilisateurs finaux avancés, Science/Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mira-assembler/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
