Il s'agit de l'application Linux nommée miRge3 dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom unmapped_tmp.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée miRge3 avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
miRge3
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DESCRIPTION
Une mise à jour du package Python pour effectuer une analyse complète des petites données de séquençage d'ARN, y compris l'annotation de miARN, l'édition A-to-I, la détection de nouveaux miARN, l'analyse isomiR, la visualisation via IGV, le traitement des identifiants moléculaires uniques (UMI), la détection de tRF et la production interactive sortie graphique.
miRge3.0 est développé en python v3.8 et est une mise à jour récente de notre version précédente miRge2.0. Cette version comprend une interface de ligne de commande (CLI) et une interface utilisateur graphique (GUI) multiplateforme. Pour plus de détails, reportez-vous au lien de documentation ci-dessous.
Audience
Organisations à but non lucratif, technologies de l'information, industrie de la santé, science/recherche, développeurs, utilisateurs finaux/ordinateur de bureau
Interface utilisateur
Électron
Langage de programmation
Python, JavaScript
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mirge3/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
