Il s'agit de l'application Linux nommée Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) dont la dernière version peut être téléchargée sous ODDT0.7.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN:
Boîte à outils ouverte de découverte de médicaments (ODDT)
DESCRIPTION:
Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) est une boîte à outils modulaire et complète à utiliser dans la chimioinformatique, la modélisation moléculaire, etc. ODDT est écrit en Python et utilise largement Numpy/Scipy. Vous pouvez utiliser n'importe quelle boîte à outils prise en charge réunie sous une API commune (pour référence, voir Pybel ou Cinfony). Toutes les méthodes et tous les logiciels basés sur Pybel/Cinfony doivent être compatibles avec les kits d'outils ODDT. Contrairement à ses prédécesseurs, qui visaient à avoir une API minimaliste, ODDT introduit des méthodes étendues et des poignées supplémentaires. Ces extensions permettent d'utiliser des boîtes à outils dans toute sa grâce et certaines fonctionnalités peuvent être rétroportées à partir d'autres pour introduire des fonctionnalités manquantes. La propriété la plus importante et la plus pratique de Molecule dans ODDT sont les dictionnaires Numpy contenant la plupart des propriétés de la molécule fournie. Certains d'entre eux sont simples, d'autres nécessitent un calcul, c'est-à-dire. caractéristiques des atomes. Des dictionnaires sont fournis pour les principales entités de molécules.
Fonctionnalités
- Des dictionnaires sont fournis pour les principales entités
- Le principal avantage est la merveilleuse diffusion et sous-ensemble de Numpy
- Chaque dictionnaire est défini comme un format dans Numpy
- Les interactions entre deux molécules sont calculées et stockées dans l'empreinte digitale
- Vérifier les interactions entre les molécules
- Vous pouvez utiliser n'importe quelle boîte à outils prise en charge réunie sous une API commune
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/oddt.mirror/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.