Il s'agit de l'application Linux nommée Seurat dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de Seurat-2.2.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Seurat avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
seurat
DESCRIPTION:
CE N'EST PLUS LA MAISON DE SEURAT. S'IL VOUS PLAÎT ALLEZ À https://sites.google.com/site/seuratsomatic/
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Seurat est un programme d'analyse de séquences pour la découverte de mutations somatiques et de déséquilibre allélique dans les tumeurs appariées et le génome et le transcriptome normaux
revendre.
Fonctionnalités
- Détection de mutations somatiques (SNV, petits indels)
- Détection de variation structurelle sur des données appariées
- Détection de déséquilibre allélique sur les données RNA-seq
- Détection de perte somatique d'hétérozygotie
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/seurat/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.