Il s'agit de l'application Linux nommée StatAlign dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom StatAlign-v2.1.zip. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée StatAlign avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
StatAlign
Ad
DESCRIPTION
StatAlign est un progiciel extensible pour l'analyse bayésienne des séquences de protéines, d'ADN et d'ARN. Des alignements multiples, des arbres phylogénétiques et des paramètres évolutifs sont co-estimés dans un cadre de Markov Chain Monte Carlo, permettant une mesure fiable de l'exactitude des résultats.
Cette approche élimine les artefacts courants dont souffrent les méthodes traditionnelles, au prix d'un temps de calcul accru. Ces artefacts incluent la dépendance de la phylogénie construite sur un seul alignement (probablement sous-optimal) et un biais vers l'arbre de guidage sur lequel repose l'alignement.
Les modèles à l'origine de l'analyse permettent la comparaison de séquences évolutivement distantes : le modèle d'insertion-délétion TKF92 peut être couplé à un modèle de substitution arbitraire. Une large gamme de modèles de données sur les nucléotides et les acides aminés est incluse dans le package et le système de gestion des plug-ins garantit que de nouveaux modèles peuvent être facilement ajoutés.
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/statalign/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
