Il s'agit de l'application Linux nommée TraceTuner à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de tracetuner_3.0.6beta.tar.bz2. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée TraceTuner pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
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TraceTuner pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Tracetuner est un outil d'appel de base et de qualité de fichiers de trace à partir d'instruments de séquençage d'ADN. Développée à l'origine par Paracel, une entreprise de Celera, cette base de code a été publiée en tant qu'open source en 2006. TraceTuner a été utilisé par Celera pour appeler plus de 30 millions de lectures à partir de projets de séquençage du génome humain et de la drosophile. En 2000, Applied Biosystems a fourni TraceTuner aux analyseurs de génome ABI3700 et l'a expédié aux clients de ces séquenceurs d'électrophorèse capillaire. Les versions ultérieures de TraceTuner, qui prennent en charge les appels de base mixtes, ont été utilisées par la communauté de la recherche, le secteur privé de la biotechnologie et le gouvernement américain en tant que composants de différentes applications logicielles de détection de variantes, de génotypage et de médecine légale (par exemple, Applied Biosystems SeqScape, Paracel Genome Assembler, MTexpert, etc.).Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande, Java Swing
Langage de programmation
C, Java, Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/tracetuner/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
