Il s'agit de l'application Windows nommée Bio::NEXUS dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Bio-NEXUS-0.78.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Bio::NEXUS avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
Biographie::NEXUS
DESCRIPTION:
Si vous gérez des données phylogénétiques, Bio::NEXUS peut vous faciliter la vie avec une bibliothèque et des outils prêts à l'emploi pour manipuler et visualiser les fichiers NEXUS (voir http://www.molevol.org/nexplorer et http://search.cpan.org/dist/Bio-NEXUS/doc/Tutorial.pod).Caractéristiques
- facile à installer : perl -MCPAN -e 'install Bio::NEXUS'
- manipuler les données dans les fichiers NEXUS à l'aide d'un outil en ligne de commande (nextool.pl)
- écrire un script personnalisé pour sélectionner (exclure) les OTU de la matrice ET de l'arbre
- écrire un script personnalisé pour re-rooter un arbre (ou mille arbres à la fois)
- générer une image PS évolutive des données et de l'arbre (nexplot.pl)
Audience
Développeurs, Autre public, Science/Recherche
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/bionexus/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.