Il s'agit de l'application Windows nommée Calis-p à exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de calis-p-0.1.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Calis-p pour une exécution gratuite sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Calis-p pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION
Calis-p (L'approche CALgary des ISOtopes en protéomique) est un progiciel permettant d'extraire directement les empreintes isotopiques stables du carbone (SIF) d'espèces individuelles dans une communauté microbienne à partir d'un ensemble de données métaprotéomiques. Il prend en entrée les tableaux de correspondance du spectre peptidique (PSM) pour les échantillons et le matériel d'étalonnage, ainsi que les données MS brutes au format mzML. Dans la première étape, le logiciel trouve les pics isotopiques pour chaque PSM et additionne leurs intensités sur une fenêtre de temps de rétention spécifiée. Les modèles isotopiques identifiés (paires de valeur m/z + intensités additionnées) ainsi que la formule de somme des peptides identifiés sont rapportés et utilisés comme entrée pour la deuxième étape de Calis-p pour calculer les valeurs delta13C pour tous les peptides qui passent un ensemble de filtres, ainsi que les valeurs moyennes de delta13C et les erreurs types pour chaque espèce. Les valeurs de l'espèce delta13C doivent être corrigées pour le fractionnement isotopique de l'instrument en appliquant le décalage déterminé à l'aide du matériau de référence.Caractéristiques
- Les données SIF sont directement extraites d'un jeu de données métaprotéomique standard
- Obtenez de manière efficace et fiable des valeurs SIF pour un grand nombre d'espèces dans un échantillon de communauté microbienne à haut débit.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
