Il s'agit de l'application Windows nommée CAMPARI dont la dernière version peut être téléchargée en tant que campari_v4_12202020.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CAMPARI avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAMPARI
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DESCRIPTION
Nous sommes fiers de vous présenter la version 4 de CAMPARI. En conservant la philosophie introduite avec la V3 pour accélérer (presque) tout à l'aide d'OpenMP (parallélisme des threads), nous avons ajouté un certain nombre de nouveaux algorithmes issus de la littérature récente, notamment un module entier traitant de petites molécules de chimie arbitraire pour les applications dans l'amarrage informatique et la conception de médicaments. Naturellement, CAMPARI continue de fournir l'implémentation de référence du paradigme de champ de force ABSINTH et du modèle de solvatation implicite.
CAMPARI est un package commun pour la réalisation et l'analyse de simulations moléculaires, en particulier de systèmes d'intérêt biologique. Il se concentre sur une large disponibilité d'algorithmes pour l'échantillonnage (avancé) et est capable de combiner Monte Carlo et la dynamique moléculaire de manière transparente. CAMPARI offre à l'utilisateur un très haut niveau de contrôle sur toutes les fonctionnalités mises en œuvre. Pour plus d'informations et de fonctionnalités, veuillez vous référer à la page d'accueil du projet à l'adresse http://campari.sourceforge.net.
Caractéristiques
- Échantillonnage combiné MC et MD, MD dans l'espace cartésien ou torsionnel/corps rigide
- Parallélisation OpenMP efficace de toutes les routines d'énergie/force de base
- Analyse ou exécution à la volée comme outil d'analyse de trajectoire (également en parallèle)
- De nombreuses routines d'analyse intégrées (DSSP, cartes de contacts, fonctions de corrélation de paires, etc.)
- Prise en charge de plusieurs clusters structurels et algorithmes associés ainsi que des analyses de modèle d'état de Markov
- Installation d'analyse autonome pour les installations de modèle de clustering/état de Markov
- Entièrement documenté (html) et en plus livré avec 16 tutoriels
- Très haut niveau de contrôle sur presque toutes les fonctionnalités prises en charge
- Large prise en charge des techniques de simulation multi-répliques parallèles comme l'échange de répliques dans l'exécution parallèle hybride MPI/OpenMP
- Prise en charge des applications de criblage de petites molécules avec paramétrage partiellement automatique
- Prise en charge de nombreux potentiels de biais (distances, positions, torsions, structure secondaire, densités spatiales, compartimentation, propriétés polymériques)
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal
Langage de programmation
Fortran
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/campari/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
