Il s'agit de l'application Windows nommée GMATA software for Genomic SSR marker dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom GMATAv2.2.jar. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée logiciel GMATA pour marqueur SSR génomique avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Logiciel GMATA pour marqueur SSR génomique
DESCRIPTION
Qu'est-ce que le logiciel GMATA v21
L'analyse des microsatellites à l'échelle du génome vers l'application (GMATA) est un logiciel pour les analyses de répétitions de séquences simples (SSR) et la conception et la cartographie de marqueurs SSR dans toutes les séquences d'ADN. Il a les fonctions suivantes :
1. L'exploitation minière SSR ;
2. Analyse statistique et traçage ;
3. Visualisation graphique des loci SSR ;
4. Conception de marqueurs ;
5. Cartographie électronique et enquête sur la transférabilité des marqueurs.
GMATA est précis, sensible et rapide. Il a été conçu pour traiter de grands ensembles de données de séquences génomiques, en particulier de grandes séquences de génome entier. En théorie, les génomes de toute taille peuvent être facilement analysés par GMATA. Le logiciel GMATA fonctionne sur un serveur, un ordinateur de bureau ou même un ordinateur portable, et il peut s'exécuter dans une interface graphique en quelques clics ou en ligne de commande ou dans un pipeline automatisé. Il est également multiplateforme et prend en charge Unix/Linux, Win et Mac. Les résultats du logiciel GMATA peuvent être directement affichés graphiquement avec les caractéristiques du génome ou des gènes dans Gbrowser et facilement intégrés à n'importe quelle base de données génomique.
Caractéristiques
- Minage SSR précis et rapide dans toutes les grandes séquences
- Analyse statistique complète et tracé
- Affichage des loci et marqueurs SSR dans Gbrowser avec les fonctionnalités du génome
- Conception de marqueurs SSR spécifiques et PCR simulée
- Cartographie électronique et enquête sur la transférabilité des marqueurs
- également disponible sur https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/gmata/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
