Il s'agit de l'application Windows nommée High-Throughput Tabular Data Processor pour s'exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom HTDP.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée High-Throughput Tabular Data Processor pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN:
Processeur de données tabulaires à haut débit pour s'exécuter sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION:
Le PROCESSEUR DE DONNÉES TABULAIRES À HAUT DÉBIT (HTDP) est une application Java destinée à faciliter les tâches d'exploration et de réduction des données dans les fichiers texte volumineux résultant des technologies à haut débit, par exemple le séquençage massivement parallèle ou les microarrays. Le logiciel a été optimisé pour les données de microarray et de séquençage parallèle profond, mais il peut accepter n'importe quel ensemble de données tabulaires délimitées par des caractères. HTDP peut également importer, traiter et convertir des fichiers VCF (Variant Call Format) ver. 4.0, 4.1 et 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).HTDP fournit une fonctionnalité de filtrage rapide et peut traiter des données constituées de fichiers d'entrée uniques ou multiples.
Citation : Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Processeur de données tabulaires à haut débit - Outil graphique indépendant de la plate-forme pour le traitement de grands ensembles de données. PLoS ONE 13(2) : e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Caractéristiques
- fonctionne sur toutes les données de colonne délimitées par des caractères (par exemple BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- fusionner des fichiers de données tabulaires verticalement et horizontalement
- fusionner tous les fichiers de données tabulaires à l'aide de l'emplacement du génome ou des colonnes communes
- capacités illimitées de filtrage et de réduction des données
- différents fichiers en termes de format et de contenu peuvent être analysés en même temps
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/htdp/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.