Il s'agit de l'application Windows nommée MendelChecker dont la dernière version peut être téléchargée sous MendelChecker_v2.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée MendelChecker avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
MendelChecker
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DESCRIPTION
MendelChecker est une mesure basée sur la vraisemblance de la ségrégation mendélienne des polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) dans les pedigrees nucléaires. Nous avons développé cette méthode comme mesure de contrôle qualité pour la découverte de nouvelles variantes à partir de données de séquençage bruyantes de nouvelle génération dans les pedigrees, telles que le séquençage d'ADN associé au site de restriction (RAD-seq) dans des organismes non modèles. Cette méthode met en œuvre la comparaison de la transmission hétérogamétique contre la transmission homogamétique, c'est-à-dire la ségrégation liée au sexe contre la ségrégation autosomique.
Caractéristiques
- Mesurer la probabilité de transmission mendélienne dans les pedigrees
- Attribution des autosomes et des chromosomes sexuels
- Lit la sortie GATK standard
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.