Il s'agit de l'application Windows nommée Calculateur de ressemblance de produit naturel dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Natural_Product_Likeness_calculator_2.1.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Calculateur de ressemblance de produit naturel avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
Calculateur de ressemblance avec un produit naturel
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DESCRIPTION
Calcule la ressemblance avec le produit naturel (NP) d'une molécule, c'est-à-dire la similitude de la molécule avec l'espace structurel couvert par les produits naturels connus. La ressemblance NP est un critère utile pour cribler des bibliothèques de composés et concevoir de nouveaux composés phares.
Dépendance Maven :
uk.ac.ebi.cheminformatics
NP-ressemblance
2.1
Référentiel requis :
ebi-repo
Référentiel EBI maven
http://www.ebi.ac.uk/~maven/m2repo
faux
La dernière version du projet est disponible ici dans notre repo GIT https://github.com/CS76/NP-Likeness
Fonctionnalités
- Vérifier les structures redondantes dans l'ensemble de données
- Standardisation des molécules (Suppression des contre-ions et des métaux)
- Supprimer les sucres linéaires et annulaires
- Générer des signatures atomiques
- Calculer la ressemblance avec un produit naturel d'une molécule donnée sur la base des données ouvertes disponibles des produits naturels
- SDF et SMILES pour les E/S
- Utilisez votre propre ensemble de formation interne pour calculer les scores
Langage de programmation
Java
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/np-likeness/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
