Il s'agit de l'application Windows nommée Protospacer Workbench dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Protospacer Workbench avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
Ad
Établi Protospacer
DESCRIPTION
Protospacer Workbench aide à concevoir, analyser et partager des sites cibles CRISPR pour tout organisme ou ensemble de séquences au format FASTA.La conception d'ARN-guides pour le système d'édition du génome CRISPR/Cas est intuitivement facile, mais difficile en termes de calcul. La principale difficulté provient de la nécessité d'identifier des cibles potentielles qui peuvent être très différentes de la cible visée. Les outils en ligne actuels pour la conception d'ARN-guides fournissent une interface conviviale aux logiciels de cartographie de séquences tels que Bowtie ou BLAST. Cependant, bien que rapides, ces algorithmes de mappage n'ont pas été conçus avec une tolérance élevée aux erreurs, une caractéristique essentielle pour déterminer les cibles potentielles. Là où les outils en ligne échouent, les outils hors ligne réussissent. Cependant, les outils hors ligne nécessitent une connaissance de la ligne de commande que peu de ceux qui utilisent CRISPR possèdent. Protospacer Workbench vise à combler le fossé entre la conception de guides-ARN en ligne et hors ligne. Le logiciel est actuellement disponible pour OS X et sera bientôt porté sur d'autres systèmes d'exploitation.
Fonctionnalités
- Trouvez rapidement toutes les cibles CRISPR disponibles
- Évaluer minutieusement les conceptions d'ARN-guide
- Partager des cibles et des listes d'ARN-guides
- Conception pour n'importe quel organisme
- Gérer plusieurs bases de données
- Flux de travail étape par étape
- Obtenez des rapports sur les performances attendues du guide-ARN
- Utilisez plusieurs outils tiers à partir d'une seule interface
- Conception multi-cibles
- Gérer de grandes listes d'ARN cibles/guides
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
