Il s'agit de l'application Windows nommée raxmlGUI dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom raxmlGUI1.5b3.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée raxmlGUI avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN
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raxmlGUI
DESCRIPTION
NOTE DE VERSION : Obtenez raxmlGUI 2.0 au NOUVEL EMPLACEMENT DU PROJET : https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/
raxmlGUI est une interface utilisateur graphique pour RAxML, l'un des logiciels les plus populaires et les plus utilisés pour l'inférence phylogénétique utilisant le maximum de vraisemblance.
Une interface graphique conviviale pour les analyses phylogénétiques utilisant RAxML (Stamatakis, 2006). Veuillez citer : Silvestro, Michalak (2012) - raxmlGUI : une interface graphique pour RAxML. Diversité et évolution des organismes 12, 335-337. DOI : 10.1007/s13127-011-0056-0
Fonctionnalités
- *NOUVELLE VERSION 2.0 MAINTENANT DISPONIBLE : https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/*
- *version 1.5* ajoute la possibilité d'exécuter des analyses via CIPRES Science Gateway
- L'interface graphique comprend des exécutables RAxML
- Compatibilité multiplateforme (Mac OS, Windows, Linux)
- Nécessite Python 2.6, 2.7
- Interface intuitive pour le partitionnement des données et la sélection de groupes externes
- Sélection de modèles pour les alignements d'ADN, d'acides aminés, binaires et multi-états
- Conversion automatique NEXUS en PHYLIP (et vice versa)
- Importer des fichiers FASTA
- Reconstruction de l'état ancestral
- Fonction « Bootstopping » (Pattengale et al. 2010)
- Exclusion interactive de sites
- Combinaison de plusieurs alignements avec partitionnement automatique
- Définition interactive des contraintes topologiques
- Distances par paires de Robinson-Foulds
- Probabilités par site
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Tk
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/raxmlgui/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
