Il s'agit de l'application Windows nommée Systems Glycobiology dont la dernière version peut être téléchargée sous GNATv2beta.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Systems Glycobiology with OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
Glycobiologie des systèmes
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DESCRIPTION
GNAT est une boîte à outils open source et indépendante de la plate-forme basée sur MATLAB. Il est écrit en MATLAB et Java. Il a été testé sur les plates-formes Windows (Windows 7), Linux (Ubuntu) et Mac OS (X Lion).
Le package GNAT original (fichier GNAT.zip) fournit des fonctions de lecture, d'écriture, de manipulation, de visualisation et de simulation des structures de glycanes et des réseaux de réaction de glycosylation (citation [1]).
La deuxième version de ce logiciel (GNATv2beta.zip) met à jour le programme GNAT original avec des fonctionnalités supplémentaires qui visent à incorporer des données expérimentales sur la structure des glycanes dans l'environnement de simulation.
Pour plus d'informations sur l'installation et l'utilisation de GNAT, veuillez consulter le fichier GettingStarted.pdf inclus dans le package.
Pour citer GNAT :
[1] Gang Liu, Apurv Puri et Sriram Neelamegham, Glycosylation Network Analysis Toolbox (GNAT): un environnement basé sur MATLAB pour la glycobiologie des systèmes, Bioinformatics 2013 29 : 404-406
Langage de programmation
Java, MATLAB
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/gnatmatlab/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.