Bowtie2-build-l - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

Bowtie2-build-l - Bowtie2 . के लिए कलरस्पेस इंडेक्स बनाना

SYNOPSIS

Bowtie2-बिल्ड-l [विकल्पों]*

वर्णन

बेन लैंगमेड द्वारा बॉटी 2 संस्करण 2.2.6 (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)

संदर्भ_इन
रेफरी अनुक्रम वाली फाइलों की अल्पविराम से अलग सूची

bt2_index_base
इस डीआईआर/बेसनाम वाली फाइलों में bt2l डेटा लिखें

*** बॉटी 2 इंडेक्स केवल v2 (v1 नहीं) के साथ काम करते हैं। इसी तरह v1 इंडेक्स के लिए। ***

विकल्प

-f संदर्भ फ़ाइलें Fasta (डिफ़ॉल्ट) हैं

-c cmd लाइन पर दिए गए संदर्भ क्रम (as .) )

-a/--नोआटो
स्वचालित अक्षम करें -p/--bmax/--dcv मेमोरी-फिटिंग

-p/--पैक
आंतरिक रूप से पैक किए गए तारों का उपयोग करें; धीमी, कम स्मृति

--बीमैक्स
ब्लॉकवाइज प्रत्यय-सरणी बिल्डर के लिए अधिकतम बकेट sz

--bmaxdivn
रेफरी लेन के भाजक के रूप में अधिकतम बाल्टी sz (डिफ़ॉल्ट: 4)

--डीसीवी
ब्लॉकवाइज के लिए डिफ-कवर अवधि (डिफ़ॉल्ट: 1024)

--नोडसी डिफ-कवर अक्षम करें (एल्गोरिदम द्विघात बन जाता है)

-r/--नोरेफ
.3/.4 अनुक्रमणिका फ़ाइलें न बनाएं

-3/--जस्टरेफ
बस .3/.4 अनुक्रमणिका फ़ाइलें बनाएं

-o/-ऑफरेट
हर 2^ . में SA का नमूना लिया जाता है बीडब्ल्यूटी वर्ण (डिफ़ॉल्ट: 5)

-t/--ftabchars
# प्रारंभिक लुकअप में खपत किए गए वर्णों की संख्या (डिफ़ॉल्ट: 10)

--बीज
यादृच्छिक संख्या जनरेटर के लिए बीज

-q/--शांत
वर्बोज़ आउटपुट (डिबगिंग के लिए)

-h/--मदद
टूल और उसके विकल्पों का विस्तृत विवरण प्रिंट करें

--उपयोग
इस उपयोग संदेश को प्रिंट करें

--संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रिंट करें और छोड़ें

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन Bowtie2-build-l का उपयोग करें