рдЕрдВрдЧреНрд░реЗрдЬрд╝реАрдлреНрд░реЗрдВрдЪрд╕реНрдкреЗрдирд┐рд╢

рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлрд╝реЗрд╡рд┐рдХреЙрди

bp_mrtransp - рдХреНрд▓рд╛рдЙрдб рдореЗрдВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди

рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдкрд░ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдореБрдлреНрдд рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ bp_mrtransp рдЪрд▓рд╛рдПрдВ

рдпрд╣ рдХрдорд╛рдВрдб bp_mrtransp рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдХрдИ рдореБрдлреНрдд рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдЬреИрд╕реЗ рдХрд┐ рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред

рдХрд╛рд░реНрдпрдХреНрд░рдо:

рдирд╛рдо


bp_mrtrans - рдкреНрд░реЛрдЯреАрди рд╕реЗ mrna рдирд┐рд░реНрджреЗрд╢рд╛рдВрдХ рддрдХ рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг рдХрд╛ рдПрдХ рдЯреНрд░рд╛рдВрд╕рдлрд╛рд░реНрдорд░ рд▓рд╛рдЧреВ рдХрд░реЗрдВ

SYNOPSIS


рдЙрдкрдпреЛрдЧ:
bp_mrtrans -i рдЗрдирдкреБрдЯрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ -o рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ [-рдпрджрд┐ рдЗрдирдкреБрдЯ рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк] [-рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдХрд╛] [-s cDNA
рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдбреЗрдЯрд╛рдмреЗрд╕] [-рдПрд╕рдПрдл рд╕реАрдбреАрдПрдирдП рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк] [-рдПрдЪ]

рд╡рд░реНрдгрди


рдпрд╣ рд╕реНрдХреНрд░рд┐рдкреНрдЯ рдкреНрд░реЛрдЯреАрди рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг рдХреЛ рд╡рд╛рдкрд╕ рд╕реАрдбреАрдПрдирдП рдореЗрдВ рдмрджрд▓ рджреЗрдЧреАред рдмрд┐рд▓ рдкрд░ рдЖрдзрд╛рд░рд┐рдд рд╣реИ
рдкрд┐рдпрд░реНрд╕рди рдХрд╛ mrtrans.

рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк рд╣реИрдВ:

-o рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо - рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо [рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ STDOUT]
-of рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк - рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк
(рдПрдХрд╛рдзрд┐рдХ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг)
[рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ рдлрд╝рд┐рд▓рд┐рдк]
-i рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо - рдЗрдирдкреБрдЯ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо [рдЖрд╡рд╢реНрдпрдХ]
-рдпрджрд┐ рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк - рдЗрдирдкреБрдЯ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк
(рдПрдХрд╛рдзрд┐рдХ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рд╕рдВрд░реЗрдЦрдг)
[рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ рдХреНрд▓рд╕реНрдЯрд░]
-s --seqdb рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо - рд╕реАрдбреАрдПрдирдП рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдбреЗрдЯрд╛рдмреЗрд╕ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓
-sf --seqformat - cDNA seq db рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк (рдлреНрд▓реИрдЯрдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдЕрдиреБрдХреНрд░рдо рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк)
-рдПрдЪ - рдпрд╣ рд╕рд╣рд╛рдпрддрд╛ рдореЗрдиреВ

onworks.net рд╕реЗрд╡рд╛рдУрдВ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ bp_mrtransp рдХрд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ


рдлреНрд░реА рд╕рд░реНрд╡рд░ рдФрд░ рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди

рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдФрд░ рд▓рд╛рдЗрдиреЗрдХреНрд╕ рдПрдк рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ

рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдХрдорд╛рдВрдб

Ad