यह कमांड bp_sreformatp है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
बीपीएसरिफॉर्मेट - अनुक्रम प्रारूपों को परिवर्तित करें
वर्णन
यह स्क्रिप्ट SeqIO प्रणाली का उपयोग करती है जो अनुक्रम प्रारूपों के रूपांतरण की अनुमति देती है
अनुक्रम डेटा या एकाधिक अनुक्रम संरेखण डेटा। यह नाम इस तथ्य से आया है कि शॉन
एडी का प्रोग्राम sreformat (HMMER pkg का हिस्सा) पहले से ही ऐसा करता है। शॉन का कार्यक्रम प्रयास करता है
इनपुट प्रारूपों का अनुमान लगाने के लिए, जबकि हमारे कोड में हमें वर्तमान में यह निर्दिष्ट करने की आवश्यकता है कि क्या है
इनपुट और आउटपुट प्रारूप हैं और यदि डेटा एकाधिक अनुक्रम संरेखण से है या से है
सीधे अनुक्रम फ़ाइलें।
उपयोग:
bpsreformat -if INFORMAT -of OUTFORMAT -i FILENAME -o आउटपुट.FORMAT
-h/--help इस सहायता को प्रिंट करें
-if/-informat इनपुट प्रारूप निर्दिष्ट करें
-of/--आउटफॉर्मेट आउटपुट स्वरूप निर्दिष्ट करें
-i/--इनपुट इनपुट फ़ाइल नाम निर्दिष्ट करें
(STDIN पर डेटा पास करने के लिए फ़ाइल नाम के रूप में ऋण चिह्न का उपयोग करें)
-o/--आउटपुट आउटपुट फ़ाइल नाम निर्दिष्ट करें
(STDOUT पर डेटा पास करने के लिए फ़ाइल नाम के रूप में ऋण चिह्न का उपयोग करें)
--msa निर्दिष्ट करें कि यह एकाधिक अनुक्रम संरेखण डेटा है
--special AlignIO/SeqIO को विशेष पैरामीटर भेजेगा
ऑब्जेक्ट - इनमें से अधिकांश Bio::AlignIO ऑब्जेक्ट के लिए हैं
निम्नलिखित की अल्पविराम से पृथक सूची
नोइंटरलीव्ड - फिलिप के लिए, नॉन-इंटरलीव्ड प्रारूप
idlinebreak -- फ़िलिप के लिए, इसे मोल्फ़ी प्रारूप बनाता है
प्रतिशत - क्लस्टर के लिए, प्रति पंक्ति % आईडी दिखाएं
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके bp_sreformatp का ऑनलाइन उपयोग करें
