यह फास्टक्यू-मल्टएक्स कमांड है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
fastq-multx - ea-utils: बारकोड फ़ाइल में % को बारकोड आईडी से बदलें
SYNOPSIS
fastq-multx [-जी|-एल|-बी] -o आर1.%.fq [दोस्त.fq -o आर2.%.fq]...
वर्णन
fastq-multx: अमान्य विकल्प -- 'एच' अज्ञात विकल्प `-एच'।
संस्करण: 1.02.684
आउटपुट फ़ाइलों में '%' चिह्न अवश्य होना चाहिए जिसे बारकोड में बारकोड आईडी से बदल दिया जाता है
फ़ाइल। आउटपुट फ़ाइल को संबंधित डेटा को त्यागने के लिए n/a किया जा सकता है (बारकोड के लिए इसका उपयोग करें)।
पढ़ना)
बारकोड फ़ाइल (-B) इस तरह दिखता है:
...
डिफ़ॉल्ट अनुमान लगाना है -बोली or -ईओएल स्पष्ट आँकड़ों के आधार पर।
If -g का उपयोग किया जाता है, तो इसका पैरामीटर एक इंडेक्स लेन है, और अक्सर होने वाले अनुक्रम होते हैं
उपयोग किया गया।
If -l का उपयोग किया जाता है तो फ़ाइल में सभी बारकोड आज़माए जाते हैं, और *समूह* को *अधिकांश* के साथ
मैचों का चयन किया जाता है।
समूहीकृत बारकोड फ़ाइल (-l or -L) इस तरह दिखता है:
...
यदि आपूर्ति की जाती है, तो मेटिड रीड्स को सिंक में रखा जाता है
विकल्प
-o FIL1 आउटपुट फ़ाइलें (प्रति इनपुट एक, आवश्यक) -g SEQFIL से बारकोड निर्धारित करें
अनुक्रमित SEQFIL पढ़ें -l बीसीएफआईएल मास्टर के रूप में बीसीएफआईएल का उपयोग करके किसी भी रीड से बारकोड निर्धारित करता है
सूची -L बीसीएफआईएल से बारकोड निर्धारित करें , मास्टर सूची के रूप में बीसीएफआईएल का उपयोग करना -B बी.सी.एफ.आई.एल
निर्दिष्ट फ़ाइल से बारकोड का उपयोग करें, कोई निर्धारण चरण न चलाएँ -b सेना
बारकोड मिलान के लिए लाइन की शुरुआत (5')। -e बैटकोड के लिए पंक्ति (3') के अंत पर बल लगाएं
मिलान -t NUM स्वत: निर्धारण के लिए सीमा को कारक NUM (1), > 1 = अधिक से विभाजित करें
संवेदनशील -G नाम केवल NAME से मेल खाने वाले समूह का उपयोग करें -x बारकोड को काट-छाँट न करें
गंतव्य लिखने से पहले -n निष्पादित न करें, बस संभावित बारकोड सूची प्रिंट करें
-v C सत्यापित करें कि संबद्ध आईडी वर्ण C से मेल खाती है (इल्लुमिना के लिए '' का प्रयोग करें) -m N
एन बेमेल तक की अनुमति दें, जब तक वे अद्वितीय हों (1) -d एन न्यूनतम आवश्यकता है
सर्वोत्तम और अगले सर्वोत्तम के बीच N की दूरी (2) -q एन न्यूनतम फ़्रेड की आवश्यकता है
बारकोड आधार स्वीकार करने के लिए एन की गुणवत्ता (0)
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके fastq-multx का ऑनलाइन उपयोग करें
