gbrowse_import_ucsc_db - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

brow_import_ucsc_db - एक फ्रेमवर्क डेटा स्रोत बनाता है

वर्णन

यह यूसीएससी जीनोम के लिए ज्ञात जीनोम में से एक के लिए एक ढांचा डेटा स्रोत बनाता है
ब्राउज़र। फिर आप डेटा स्रोत कॉन्फ़िगरेशन फ़ाइल को संशोधित कर सकते हैं, अपना डेटा जोड़ सकते हैं, और इसी तरह
आगे। UCSC जीनोम बिल्ड का नाम और वैकल्पिक रूप से प्रदर्शित करने के लिए विवरण प्रदान करें
जीबी ब्राउज़ करें।

आरंभ करने के लिए, पर जाकर वांछित डेटा स्रोत खोजें http://genome.ucsc.edu/cgi-
bin/hgGateway और वांछित प्रजातियों पर नेविगेट करने के लिए "क्लैड" और "जीनोम" मेनू का उपयोग करना
और निर्माण संख्या। आपको नेविगेशन के नीचे नीले बॉक्स में डेटा स्रोत का नाम मिलेगा
नियंत्रण। कुछ इस तरह की तलाश करें:

D. मेलानोगास्टर जीनोम ब्राउज़र - dm3 असेंबली (अनुक्रम)

डेटा स्रोत का नाम "असेंबली" शब्द से पहले दिखाई देता है, इस मामले में "dm3"।

उपयोग

[विकल्प] [ ]

विकल्प

यूसीएससी द्वारा मान्यता प्राप्त सभी स्रोतों की सूची प्राप्त करने के लिए टाइप करें:

ब्राउज़_इम्पोर्ट_ucsc_db --सूची

विकल्प:
--remove-chr सभी गुणसूत्र नामों से 'chr' उपसर्ग हटा दें
--सूची सूची डेटा स्रोत

उदाहरण

उदाहरण: $0 hg19 'मानव जीनोम (hg19)'

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन gbrowse_import_ucsc_db का उपयोग करें