gmx-pme_error - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

gmx-pme_error - किसी दिए गए इनपुट फ़ाइल के साथ PME का उपयोग करने में त्रुटि का अनुमान लगाएं

SYNOPSIS

जीएमएक्स pme_error [-s [<.tpr>]] [-o [<.बाहर>]] [-इसलिए [<.tpr>]] [-बीटा ]
[-[नहीं]धुन] [-खुद ] [बीज ] [-[नहीं]वी]

वर्णन

GMX pme_error यदि एसपीएमई एल्गोरिदम का उपयोग किया जाए तो इलेक्ट्रोस्टैटिक बलों की त्रुटि का अनुमान लगाया जाता है।
झंडा -तराना विभाजन पैरामीटर को इस प्रकार निर्धारित करेगा कि त्रुटि समान हो
वास्तविक और पारस्परिक स्थान भाग पर वितरित। त्रुटि का वह भाग जो उत्पन्न होता है
कणों की स्व-अंतःक्रिया से कम्प्यूटेशनल रूप से मांग होती है। हालाँकि, एक अच्छा ए
सन्निकटन का तात्पर्य इस शब्द के लिए कणों के एक अंश का उपयोग करना है जो हो सकता है
ध्वज द्वारा दर्शाया गया है -खुद.

विकल्प

इनपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:

-s [<.tpr>] (टॉपोल.टीपीआर)
पोर्टेबल xdr रन इनपुट फ़ाइल

आउटपुट फ़ाइलों को निर्दिष्ट करने के विकल्प:

-o [<.बाहर>] (त्रुटि.आउट)
सामान्य आउटपुट फ़ाइल

-इसलिए [<.tpr>] (ट्यूनेड.टीपीआर) (वैकल्पिक)
पोर्टेबल xdr रन इनपुट फ़ाइल

अन्य विकल्प:

-बीटा (-1)
यदि सकारात्मक है, तो ewald_beta को अधिलेखित करें टीपीआर इस मान के साथ फ़ाइल करें

-[नहीं]धुन (नहीं)
विभाजन पैरामीटर को ऐसे ट्यून करें कि त्रुटि समान रूप से वितरित हो
वास्तविक और पारस्परिक स्थान

-खुद (1)
यदि 0.0 और 1.0 के बीच है, तो केवल इस अंश से सेल्फ इंटरेक्शन त्रुटि निर्धारित करें
आवेशित कण

बीज (0)
मोंटे कार्लो एल्गोरिदम के लिए यादृच्छिक संख्या बीज का उपयोग कब किया जाता है -खुद एक मान पर सेट है
0.0 और 1.0 के बीच

-[नहीं]वी (नहीं)
जोर से और शोर करो

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके gmx-pme_error का ऑनलाइन उपयोग करें