hmm-assembler.pl - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

hmm-assembler.pl - SNAP मॉड्यूल hmm-assembler.pl

SYNOPSIS

हम्म-असेंबलर.pl [-विकल्प [-अधिक विकल्प]] [--] [प्रोग्राम_ARG1 ...]

विकल्प

RSI निम्नलिखित एकल वर्ण विकल्पों रहे स्वीकार किए जाते हैं:
तर्कों के साथ: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c

बूलियन (बिना तर्क के): -r -o -x -p -t -1

विकल्पों को एक साथ मर्ज किया जा सकता है. -- विकल्पों का प्रसंस्करण बंद कर देता है। जगह की आवश्यकता नहीं है
विकल्पों और उनके तर्कों के बीच।

विकल्प:

-i [500]

-e [1000]

-A [0:30]

-D [0:9]

-M [0:15]

-S [0:9]

-C [4]

-I [4]

-N [4]

-3 [] 3'यूटीआर मॉडल शामिल करें, आवश्यक है -a

-a [] पॉलीए मॉडल शामिल करें, आवश्यक है -3

-5 [] 5'यूटीआर मोएल शामिल करें, आवश्यक है -p

-p जेनेरिक प्रमोटर मॉडल को शामिल करने की आवश्यकता है -5

-r जेनेरिक रिपीट मॉडल शामिल करें

-o रिवर्स ओआरएफ मॉडल शामिल करें

-x स्पष्ट अवधि इंट्रॉन मॉडल का उपयोग करें

-t सी.एलिगेंस ट्रांस-स्प्लिसिंग शामिल करें, आवश्यक है -p, -5

-Z क्लैड-विशिष्ट मान सेट करता है (कीड़ा, मक्खी, पौधा)

-1 एकल जीन मॉडल

-c
जीसी-एजी स्प्लिस डोनर मॉडल शामिल करें

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