рдЕрдВрдЧреНрд░реЗрдЬрд╝реАрдлреНрд░реЗрдВрдЪрд╕реНрдкреЗрдирд┐рд╢

рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлрд╝реЗрд╡рд┐рдХреЙрди

рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ - рдХреНрд▓рд╛рдЙрдб рдореЗрдВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди

рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдкрд░ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ рдЪрд▓рд╛рдПрдВред

рдпрд╣ рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ рдХрдорд╛рдВрдб рд╣реИ рдЬрд┐рд╕реЗ рд╣рдорд╛рд░реЗ рдХрдИ рдореБрдлреНрдд рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди рдЬреИрд╕реЗ рдХрд┐ рдЙрдмрдВрдЯреВ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рдлреЗрдбреЛрд░рд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди, рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдпрд╛ рдореИрдХ рдУрдПрд╕ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдПрдореБрд▓реЗрдЯрд░ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдСрдирд╡рд░реНрдХреНрд╕ рдлреНрд░реА рд╣реЛрд╕реНрдЯрд┐рдВрдЧ рдкреНрд░рджрд╛рддрд╛ рдореЗрдВ рдЪрд▓рд╛рдпрд╛ рдЬрд╛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИред

рдХрд╛рд░реНрдпрдХреНрд░рдо:

рдирд╛рдо


рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ - рдПрдордУрдПрд▓ рдпрд╛ рдПрд╕рдбреАрдПрдл рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк рдореЗрдВ рдЕрдгреБрдУрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдХреИрдиреЛрдирд┐рдХрд▓ рд╕реНрдорд╛рдЗрд▓реНрд╕ рдпрд╛ рд╕реНрддрд░рд┐рдд рдХреЛрдб рдХрд╛ рдЙрддреНрдкрд╛рджрди рдХрд░реЗрдВ

SYNOPSIS


рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдирд╛рдо.{mol,rdf,rdf.gz,sdf,sdf.gz,smi} [рдкреИрд░рд╛рдореАрдЯрд░]

рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ - рдореБрд╕реНрдХрд╛рди [рдкреИрд░рд╛рдореАрдЯрд░]

рд╡рд░реНрдгрди


рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ MOL рдпрд╛ рдореЗрдВ рдЕрдгреБрдУрдВ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд╡рд┐рд╣рд┐рдд рдореБрд╕реНрдХрд╛рди рдпрд╛ рд╕реНрддрд░рд┐рдд рдХреЛрдб рдХрд╛ рдЙрддреНрдкрд╛рджрди рдХрд░рдиреЗ рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИ
рдПрд╕рдбреАрдПрдл рдкреНрд░рд╛рд░реВрдк.

рд╡рд┐рдХрд▓реНрдк


рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ рдорд╛рдирдХ рдЗрдирдкреБрдЯ рдкрд░ рдПрдХ рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдпрд╛ SMILES рдХреЛрдб рдХреА рдЕрдкреЗрдХреНрд╖рд╛ рдХрд░рддрд╛ рд╣реИ, рдЬреЛ рддрдм рд╣реЛ рд╕рдХрддрд╛ рд╣реИ
рдЗрд╕рдХреЗ рдмрд╛рдж рдирд┐рдореНрдирд▓рд┐рдЦрд┐рдд рдореЗрдВ рд╕реЗ рдПрдХ рдпрд╛ рдЕрдзрд┐рдХ рдкреИрд░рд╛рдореАрдЯрд░ рд╣реЛрдВрдЧреЗред

-рдореБрд╕реНрдХрд╛рди
рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рд╡рд┐рд╣рд┐рдд рдореБрд╕реНрдХрд╛рди (рдбрд┐рдлрд╝реЙрд▓реНрдЯ)

-рд╕реНрддрд░рд┐рдд
рдЖрдЙрдЯрдкреБрдЯ рдХреИрдиреЛрдирд┐рдХрд▓ рд╕реНрддрд░рд┐рдд рдХреЛрдб

-рдпрд╛рдж
рдПрд╕рдбреАрдПрдл рдлрд╝рд╛рдЗрд▓ рдореЗрдВ рджрд┐рдП рдЧрдП рдирд╛рдо рдХреЗ рд╕рд╛рде рдЖрдИрдбреА рдлрд╝реАрд▓реНрдб

-рдХреЛрдИ рд╕реБрдЧрдВрдз рдирд╣реАрдВ
рдЕрдгреБрдУрдВ рдХреЛ рд╕реБрдЧрдВрдзрд┐рдд рди рдХрд░реЗрдВ

-рдиреЛ-рдЯреЗрдЯреНрд░рд╛рд╣реЗрдбреНрд░рд▓
рдЯреЗрдЯреНрд░рд╛рд╣реЗрдбреНрд░рд▓ рд╕реНрдЯреАрд░рд┐рдпреЛрд╕реЗрдВрдЯрд░ рдкрд░ рдзреНрдпрд╛рди рди рджреЗрдВ

-рдиреЛ-рд╕рд┐рд╕реНрдЯреНрд░рд╛рдиреНрд╕
рд╕реАрдЖрдИрдПрд╕-рдЯреНрд░рд╛рдВрд╕ рдмрд╛рдВрдб рдЬрд╛рдирдХрд╛рд░реА рдкрд░ рдзреНрдпрд╛рди рди рджреЗрдВ

рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг


рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ infile.sdf
рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ infile.sdf.gz -рдпрд╛рдж рдореЛрд▓рд░реЗрдЧреНрдиреЛ > рдкрд░рд┐рдгрд╛рдо.txt
рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ infile.smi -рд╕реНрддрд░рд┐рдд -рдиреЛ-рд╕рд┐рд╕реНрдЯреНрд░рд╛рдиреНрд╕
рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ - 'NC1C=CC(O)=CC=1'

onworks.net рд╕реЗрд╡рд╛рдУрдВ рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░рдХреЗ рдЗрдВрдбрд┐рдЧреЛ-рдХреИрдиреЛ рдХрд╛ рдСрдирд▓рд╛рдЗрди рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВ


рдлреНрд░реА рд╕рд░реНрд╡рд░ рдФрд░ рд╡рд░реНрдХрд╕реНрдЯреЗрд╢рди

рд╡рд┐рдВрдбреЛрдЬ рдФрд░ рд▓рд╛рдЗрдиреЗрдХреНрд╕ рдПрдк рдбрд╛рдЙрдирд▓реЛрдб рдХрд░реЗрдВ

рд▓рд┐рдирдХреНрд╕ рдХрдорд╛рдВрдб

Ad