इंडिगो-चित्रण - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

नील-चित्रण - अणु एवं प्रतिक्रिया प्रतिपादन उपयोगिता

SYNOPSIS

नील-चित्रण infile.{mol,rxn,cml,smi} आउटफ़ाइल.{पीएनजी,एसवीजी,पीडीएफ} [पैरामीटर]

नील-चित्रण infile। {सीएमएल, rdf, rdf.gz, sdf, sdf.gz, smi} आउटफ़ाइल_%s.{png,svg,pdf} [पैरामीटर]

नील-चित्रण infile.smi आउटफ़ाइल। {सीएमएल, मोल, आरडीएफ, आरएक्सएन, एसडीएफ} [पैरामीटर]

नील-चित्रण - मुस्कान आउटफ़ाइल। {सीएमएल, मोल, पीडीएफ, पीएनजी, आरएक्सएन, एसवीजी} [पैरामीटर]

नील-चित्रण -मदद

वर्णन

नील-चित्रण अणुओं को चित्रित करने के लिए उपयोग किया जाता है।

विकल्प

नील-चित्रण मानक इनपुट से इनपुट फ़ाइलें या SMILES कोड पढ़ सकते हैं। ये हो सकते हैं
इसके बाद निम्नलिखित में से एक या अधिक पैरामीटर होंगे।

-w
चित्र की चौड़ाई पिक्सेल में

-h
चित्र की ऊंचाई पिक्सेल में

-गहरा संबंध
पिक्सेल में औसत बॉन्ड लंबाई

-मार्जिन
क्षैतिज और ऊर्ध्वाधर मार्जिन, पिक्सेल में. डिफ़ॉल्ट रूप से कोई मार्जिन नहीं

-मोटाई
सापेक्ष मोटाई कारक सेट करें। डिफ़ॉल्ट है 1.0

-रेखा की चौडाई
बॉन्ड लाइन चौड़ाई कारक सेट करें। डिफ़ॉल्ट है 1.0

-लेबल
एटम लेबल डिस्प्ले मोड सेट करें। डिफ़ॉल्ट है टर्मिनल-हेटेरो

-हाइड्रो
अंतर्निहित हाइड्रोजन दिखाएँ. डिफ़ॉल्ट है on

-[डी]सुगंध
बल [डी]सुगंधीकरण

-स्टेरियो
स्टीरियोग्रुप डिस्प्ले मोड. डिफ़ॉल्ट है पुराना

-cdbwsa
केंद्र डबल बॉन्ड जिसमें आसन्न स्टीरियो बॉन्ड होता है (डिफ़ॉल्ट रूप से अक्षम)

-जिज्ञासा इनपुट को क्वेरी अणु या प्रतिक्रिया के रूप में मानें (डिफ़ॉल्ट रूप से अक्षम)

-स्मार्ट
इनपुट को SMARTS क्वेरी अणु या प्रतिक्रिया के रूप में मानें (डिफ़ॉल्ट रूप से अक्षम)

-आईडीफील्ड
सहेजी गई फ़ाइलों के नाम में '%s' के स्थान पर SDF/RDF फ़ील्ड डालें (डिफ़ॉल्ट है)।
अणु/प्रतिक्रिया संख्या)

-उत्प्रेरक
प्रतिक्रिया उत्प्रेरक प्लेसमेंट तीर wrt. डिफ़ॉल्ट है ऊपर और नीचे

-टिप्पणी
अणु या प्रतिक्रिया के ऊपर रखी जाने वाली टेक्स्ट टिप्पणी। कोई डिफ़ॉल्ट मान नहीं

-टिप्पणीऑफ़सेट
टिप्पणी और संरचना के बीच लंबवत स्थान (पिक्सेल में)।

-टिप्पणीक्षेत्र
टिप्पणी के रूप में निर्दिष्ट एसडीएफ/आरडीएफ फ़ील्ड का उपयोग करें

-टिप्पणीनाम
टिप्पणी के रूप में अणु/प्रतिक्रिया नाम का प्रयोग करें

-टिप्पणीआकार
बांड की मोटाई के सापेक्ष पाठ टिप्पणी फ़ॉन्ट आकार कारक। डिफ़ॉल्ट है 6

-कमेंटपोज़
पाठ टिप्पणी स्थिति (डिफ़ॉल्ट रूप से नीचे)

-टिप्पणीसंरेखण <0..1>
पाठ टिप्पणी संरेखण, एक फ़्लोट मान: 0 =बाएं, 0.5 = केंद्र, 1 = सही

-रंग
रंग सक्षम/अक्षम करें. डिफ़ॉल्ट है on

-एचएलमोटा
मोटी रेखाओं और बोल्ड अक्षरों के साथ हाइलाइटिंग सक्षम करें

-hlcolor
रंग के साथ हाइलाइटिंग सक्षम करें. घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-बीजीकलर
पृष्ठभूमि का रंग सेट करें. घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-आधारभूत रंग
डिफ़ॉल्ट अग्रभूमि रंग सेट करें. घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-आमरंग
एएएम सूचकांकों का रंग सेट करें। घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-डीएसजीरंग
डेटा SGroups का रंग सेट करें। घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-टिप्पणीरंग
टिप्पणी का रंग सेट करें. घटक मान सीमा में होने चाहिए [0 255 ..]

-परमाणुसंख्या
परमाणु संख्याएँ दिखाएँ (केवल डिबगिंग प्रयोजनों के लिए)

-बॉन्डनंबर
बांड नंबर दिखाएं (केवल डिबगिंग उद्देश्यों के लिए)

-एक आधारित
परमाणु और बंधन सूचकांकों को एक से प्रारंभ करें। डिफ़ॉल्ट शून्य से है

-मदद इस सहायता संदेश को प्रिंट करें

उदाहरण

नील-चित्रण infile.mol आउटफ़ाइल.png -रंग बंद -सुगंध
नील-चित्रण डेटाबेस.sdf अणु_%s.png -आईडीफील्ड सीडीब्रेग्नो -मोटाई 1.1
नील-चित्रण डेटाबेस.smi डेटाबेस.sdf
नील-चित्रण - CC.[O-][*-]([O-])=O query.png -जिज्ञासा
नील-चित्रण - ओसीओ>>सीसी(सी)एन प्रतिक्रिया.rxn

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके इंडिगो-चित्रण का ऑनलाइन उपयोग करें