यह कमांड kmc_tools-filter है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
kmc_tools-filter - बहुत कम संख्या में k-mers के साथ रीड्स को फ़िल्टर करें
SYNOPSIS
kmc_tools फ़िल्टर [kmc_input_db_params]
[input_read_set_params] [आउटपुट_रीड_सेट_पैराम्स]
वर्णन
यह कमांड बहुत कम संख्या में के-मर्स के साथ रीड्स को फ़िल्टर करता है।
विकल्प
K-mers डेटाबेस के लिए अतिरिक्त पैरामीटर हैं:
-सीआई
से कम होने वाले k-mers को बाहर करें बार
-सीएक्स
से अधिक होने वाले k-mers को बाहर करें बार
रीड्स के इनपुट सेट के लिए अतिरिक्त पैरामीटर हैं:
-सीआई
मान से कम k-mer वाले रीड्स हटाएं। यह पूर्णांक या फ़्लोटिंग संख्या हो सकती है
सीमा में [0.0;1.0]
-सीआई
मान से अधिक k-mers वाले रीड्स को हटा दें। यह पूर्णांक या फ़्लोटिंग संख्या हो सकती है
सीमा में [0.0;1.0]
-एफ
FASTA प्रारूप (-fa), FASTQ प्रारूप (-fq) में इनपुट; डिफ़ॉल्ट: FASTQ
रीड्स के आउटपुट सेट के लिए अतिरिक्त पैरामीटर हैं:
-एफ
FASTA प्रारूप (-fa), FASTQ प्रारूप (-fq) में आउटपुट; डिफ़ॉल्ट: इनपुट के समान
उदाहरण
kmc_tools फ़िल्टर kmc_db -ci3 इनपुट.fastq -ci0.5 -cx1.0 फ़िल्टर किया गया.fastq
kmc_tools फ़िल्टर kmc_db इनपुट.fastq -ci10 -cx100 फ़िल्टर किया गया.fastq
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके kmc_tools-filter का ऑनलाइन उपयोग करें
