मिया-3dbrainextractT1 - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

मिया-3डीब्रेनएक्सट्रैक्टटी1 - 3डी टी1 एमआरआई हेड इमेज से मस्तिष्क निकालें।

SYNOPSIS

मिया-3dbrainextractT1 -i -o [विकल्प]

वर्णन

मिया-3dbrainextractT1 इस प्रोग्राम का उपयोग T1 MR छवियों से मस्तिष्क को निकालने के लिए किया जाता है। यह पहले
3डी की सुविधा के लिए एक संयुक्त फ़ज़ी सी-मीन्स क्लस्टरिंग और बी-फ़ील्ड सुधार चलाता है
3D छवि का विभाजन. फिर सफेद पदार्थ प्राप्त करने के लिए विभिन्न फ़िटर चलाए जाते हैं
प्रारंभिक मास्क के रूप में विभाजन, जिसका उपयोग मास्क प्राप्त करने के लिए बढ़ते हुए क्षेत्र को चलाने के लिए किया जाता है
संपूर्ण मस्तिष्क. अंत में, इस मास्क का उपयोग मस्तिष्क को B0 फ़ील्ड से निकालने के लिए किया जाता है
सही छवियाँ.

विकल्प

-i --in-file=(इनपुट, आवश्यक); कब
इनपुट छवि(ओं) को खंडित किया जाना है समर्थित फ़ाइल प्रकारों के लिए देखें
प्लगइन्स: 3dimage/io

-ओ --आउट-फाइल = (आउटपुट, आवश्यक); कब
ब्रेन मास्क समर्थित फ़ाइल प्रकारों के लिए प्लगइन्स देखें: 3dimage/io

-एन --नो-ऑफ-क्लास = 3
कक्षाओं की संख्यावर्गों की संख्या

-w --wm-वर्ग=2
सफेद पदार्थ का सूचकांक सफेद पदार्थ का सूचकांक

-p --wm-prob=0.7
प्रारंभिक मुखौटा निर्माण के लिए श्वेत पदार्थ वर्ग की संभावनाश्वेत पदार्थ वर्ग
प्रारंभिक मुखौटा निर्माण की संभावना

-t --ग्रोथ-थ्रेसहोल्ड=20
क्षेत्र में वृद्धि के लिए तीव्रता सीमा क्षेत्र में वृद्धि के लिए तीव्रता सीमा

--ग्रो-शेप=18n
पड़ोस का मुखौटा क्षेत्र बढ़ रहा है

मदद & जानकारी
-V --verbose=चेतावनी
आउटपुट की वर्बोसिटी, दिए गए स्तर के प्रिंट संदेश और उच्च प्राथमिकताएं।
निम्नतम स्तर से शुरू होने वाली समर्थित प्राथमिकताएं हैं:
पता ‐निम्न स्तर के संदेश
निशान फंक्शन कॉल ट्रेस
असफल परीक्षण विफलताओं की रिपोर्ट करें
चेतावनी चेतावनी
त्रुटि रिपोर्ट त्रुटियाँ
डिबग डीबग आउटपुट
message ‐ सामान्य संदेश
घातक केवल घातक त्रुटियों की रिपोर्ट करें

--कॉपीराइट
कॉपीराइट जानकारी प्रिंट करें

-एच --सहायता
इस सहायता को प्रिंट करें

-? --उपयोग
एक छोटी सहायता प्रिंट करें

--संस्करण
संस्करण संख्या प्रिंट करें और बाहर निकलें

प्रसंस्करण
--धागे=-1
प्रसंस्करण के लिए उपयोग किए जाने वाले थ्रेड्स की अधिकतम संख्या, यह संख्या कम होनी चाहिए
या मशीन में तार्किक प्रोसेसर कोर की संख्या के बराबर। (-1:
स्वचालित अनुमान)। प्रसंस्करण के लिए उपयोग किए जाने वाले धागे की अधिकतम संख्या, यह
संख्या तार्किक प्रोसेसर कोर की संख्या के बराबर या कम होनी चाहिए
मशीन। (-1: स्वचालित अनुमान)।

प्लगइन्स: 3डिमेज/आईओ

विश्लेषण करें 7.5 छवि का विश्लेषण करें

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .HDR, .hdr

समर्थित तत्व प्रकार:
अहस्ताक्षरित 8 बिट, 16 बिट पर हस्ताक्षर किए, 32 बिट पर हस्ताक्षर किए, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट,
फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

डेटापूल वर्चुअल आईओ से और आंतरिक डेटा पूल से

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .@

डाइकोम Dicom छवि श्रृंखला 3D . के रूप में

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .DCM, .dcm

समर्थित तत्व प्रकार:
16 बिट हस्ताक्षरित, अहस्ताक्षरित 16 बिट

एचडीएफ5 HDF5 3D छवि IO

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .H5, .h5

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, हस्ताक्षरित 64 बिट, अहस्ताक्षरित 64 बिट, फ्लोटिंग
पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

इनरिया INRIA छवि

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .INR, .inr

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

MHD MetaIO 3D छवि IO VTK कार्यान्वयन (प्रयोगात्मक) का उपयोग कर रहा है।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

निफ्टी निफ्टी-1 3डी इमेज आईओ

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .NII, .nii

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, हस्ताक्षरित 64 बिट, अहस्ताक्षरित 64 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32
बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

VFF वीएफएफ सन रास्टर प्रारूप

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VFF, .vff

समर्थित तत्व प्रकार:
अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट

विस्टा 3 डी दृश्य

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .V, .VISTA, .v, .vista

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64
बिट

vti 3D छवि VTK-XML इन- और आउटपुट (प्रयोगात्मक)।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VTI, .vti

समर्थित तत्व प्रकार:
हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट, हस्ताक्षरित 32
बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64 बिट

VTK 3D VTK छवि विरासत इन- और आउटपुट (प्रयोगात्मक)।

मान्यता प्राप्त फ़ाइल एक्सटेंशन: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

समर्थित तत्व प्रकार:
बाइनरी डेटा, हस्ताक्षरित 8 बिट, अहस्ताक्षरित 8 बिट, हस्ताक्षरित 16 बिट, अहस्ताक्षरित 16 बिट,
हस्ताक्षरित 32 बिट, अहस्ताक्षरित 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 32 बिट, फ्लोटिंग पॉइंट 64
बिट

उदाहरण

Inpt छवि पर 5-वर्ग विभाजन चलाकर इनपुट छवि से एक मास्क बनाएं
इनपुट.वी और क्लास 4 को व्हाइट मैटर क्लास के रूप में उपयोग करें और मास्क्ड इमेज को मास्क्ड.वी में स्टोर करें
B0.v में B0-फ़ील्ड सही छवि

मिया-3dbrainextractT1 -i इनपुट.v -n 5 -w 4 -o नकाबपोश.v

लेखक

गर्ट वोल्नी

कॉपीराइट

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पूरी तरह से बिना किसी वारंटी के और आप इसे जीएनयू की शर्तों के तहत पुनर्वितरित कर सकते हैं
सामान्य सार्वजनिक लाइसेंस संस्करण 3 (या बाद में)। अधिक जानकारी के लिए प्रोग्राम चलाएँ
विकल्प '--कॉपीराइट'।

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके mia-3dbrainextractT1 का ऑनलाइन उपयोग करें