NDist - क्लाउड में ऑनलाइन

उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर पर ऑनवर्क्स मुफ्त होस्टिंग प्रदाता में एनडीिस्ट चलाएं

यह कमांड NDist है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।

उबंटू में चलाएं फेडोरा में दौड़ें विंडोज सिम में चलाएं मैकोज़ सिम में चलाएं

कार्यक्रम:

नाम

AmpliconNoise - उच्च थ्रूपुट न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम डेटा से शोर को हटा दें

VERSION

यह दस्तावेज़ीकरण संस्करण 1.22 . को संदर्भित करता है

SYNOPSIS

देख /usr/share/doc/ampliconnoise/Doc.pdf.gz चलाने के तरीके के विवरण के लिए।

वर्णन

निम्नलिखित उपकरण शामिल हैं। उनमें से अधिकांश के पास MPI समकक्ष है, उदाहरण के लिए
SeqNoise के बराबर SeqNoiseM है जिसका उपयोग mpirun के साथ किया जा सकता है।

फास्टा यूनिक - फास्टा फ़ाइल को निष्क्रिय करता है
-इन स्ट्रिंग इनपुट फ़ाइल नाम
विकल्प:

एफक्लस्टर
-इन स्ट्रिंग दूरी इनपुट फ़ाइल नाम
-आउट स्ट्रिंग आउटपुट फ़ाइल स्टब
विकल्प:
-आर संकल्प
-एक औसत जुड़ाव
-w वजन का उपयोग करें
-मैं पहचानकर्ताओं को पढ़ता हूं
-एस स्केल जिला।

एनडीआईएसटी - एक फास्टा फ़ाइल से जोड़ीदार नीडलमैन-वुन्श अनुक्रम दूरी मैट्रिक्स
-इन स्ट्रिंग फाटा फ़ाइल नाम
विकल्प:
-मैं आउटपुट पहचानकर्ता

Perseus - राक्षसों को मारता है
-सिन स्ट्रिंग seq फ़ाइल का नाम
विकल्प:
-टिन स्ट्रिंग संदर्भ अनुक्रम फ़ाइल
-एक आउटपुट संरेखण
-डी असंतुलन का उपयोग करें
-रिन स्ट्रिंग लुकअप फ़ाइल का नाम

पायरोडिस्ट - फ्लोग्राम से जोड़ीवार दूरी मैट्रिक्स
-इन स्ट्रिंग फ्लो फ़ाइल नाम
-आउट स्टब आउट फाइल स्टब
विकल्प:
-ni डेटा फ़ाइल में कोई अनुक्रमणिका नहीं है
-रिन स्ट्रिंग लुकअप फ़ाइल का नाम

आतिशबाज़ी - संरेखण के बिना क्लस्टर फ्लोग्राम
-दिन स्ट्रिंग प्रवाह फ़ाइल का नाम
-आउट स्ट्रिंग क्लस्टर इनपुट फ़ाइल नाम
-लिन स्ट्रिंग सूची फ़ाइल
विकल्प:
-वी वर्बोज़
-सी डबल प्रारंभिक कट-ऑफ
-ni डेटा फ़ाइल में कोई अनुक्रमणिका नहीं है
-एस डबल परिशुद्धता
-रिन फ़ाइल लुकअप फ़ाइल का नाम

सेकडिस्ट - फास्टा फ़ाइल से जोड़ीवार दूरी मैट्रिक्स
-इन स्ट्रिंग फास्टा फ़ाइल नाम
विकल्प:
-मैं आउटपुट पहचानकर्ता
-रिन स्ट्रिंग लुकअप फ़ाइल का नाम

SeqNoise - क्लस्टर अनुक्रम
-इन स्ट्रिंग अनुक्रम फ़ाइल नाम
-दिन स्ट्रिंग दूरी मैट्रिक्स फ़ाइल नाम
-आउट स्ट्रिंग क्लस्टर इनपुट फ़ाइल नाम
-लिन स्ट्रिंग सूची फ़ाइल
विकल्प:
-मिनट मैपिंग फ़ाइल
-वी वर्बोज़
-सी डबल प्रारंभिक कट-ऑफ
-एस डबल परिशुद्धता
-रिन स्ट्रिंग लुकअप फ़ाइल का नाम

स्प्लिटक्लस्टर ईवन
-दिन स्ट्रिंग डेटा फ़ाइल नाम
-मिन स्ट्रिंग मैप फ़ाइल नाम
-टिन स्ट्रिंग ट्री फ़ाइल नाम
-एस विभाजित आकार
-एम न्यूनतम आकार

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