पैलॉजिस्ट - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

पैलॉजिस्ट - लॉजिस्टिक मॉडल का उपयोग करके जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषण करें

SYNOPSIS

palogist [ कमांड लाइन विकल्पों ]

वर्णन

palogist बड़े आरोपित डेटा सेटों पर कुशल तरीके से एक रैखिक प्रतिगमन चलाता है।

ऑप्शंस

अपेक्षित आदेश line विकल्पों
-पी, --फेनो फ़ाइल
से फेनोटाइप डेटा पढ़ें फ़ाइल

-मैं, --जानकारी फ़ाइल
एसएनपी जानकारी यहां से पढ़ें फ़ाइल (उदाहरण के लिए MLINFO फ़ाइल)।

-डी, --खुराक फ़ाइल
एसएनपी भविष्यवक्ता (उदाहरण के लिए MLDOSE/MLPROB) फ़ाइल नाम।

ऐच्छिक आदेश line विकल्पों
-एम, --नक्शा फ़ाइल
मानचित्र फ़ाइल नाम, जिसमें प्रत्येक एसएनपी के लिए आधार जोड़ी स्थिति शामिल है।

-एन, --निड्स नंबर
विश्लेषण करने के लिए लोगों की संख्या.

-सी, --क्रोम फ़ाइल
क्रोमोसोम (आउटपुट में पारित किया जाना है)।

-ओ, --बाहर फ़ाइल
आउटपुट फ़ाइल नाम (डिफ़ॉल्ट है प्रतिगमन.आउट.txt ).

-एस, --स्किपड नंबर
प्रेडिक्टर (खुराक/प्रोब) फ़ाइल में कितने कॉलम छोड़ें (डिफ़ॉल्ट 2 है)।

-टी, --ntrait नंबर
कितने लक्षणों का विश्लेषण किया गया (डिफ़ॉल्ट 1 है)।

-जी, --ngpreds नंबर
प्रति मार्कर कितने भविष्यवक्ता कॉलम (डिफ़ॉल्ट 1 = MLDOSE; अन्यथा MLPROB के लिए 2 का उपयोग करें)।

-ए --अलग फ़ाइल
फ़ील्ड को अलग करने के लिए वर्ण (डिफ़ॉल्ट स्थान है)।

-आर, --स्कोर
स्कोर परीक्षण का प्रयोग करें.

-e, --सिर नहीं
आउटपुट में हेडर लाइन की रिपोर्ट न करें.

-l --allcov
सभी सहसंयोजकों (बड़े आउटपुट!) के लिए रिपोर्ट अनुमान।

-बी, --इंटरैक्शन
एसएनपी विश्लेषण के साथ बातचीत के लिए किस सहसंयोजक का उपयोग करना है (डिफ़ॉल्ट नहीं है
अंतःक्रिया, 0).

-क, --केवल बातचीत
पसंद --इंटरैक्शन लेकिन एसएनपी के साथ बातचीत में सहसंयोजक अभिनय के बिना (डिफ़ॉल्ट है
कोई बातचीत नहीं, 0).

-में, --एमएमस्कोर फ़ाइल
संबंधित व्यक्तियों के नमूनों में स्कोर परीक्षण। फ़ाइल तर्क का नाम है
व्युत्क्रम सहसंबंध मैट्रिक्स के साथ फ़ाइल। ध्यान दें कि यह सुविधा अभी भी है
प्रयोगात्मक!

--मज़बूत
मजबूत (उर्फ सैंडविच, उर्फ ​​ह्यूबर्ट-व्हाइट) मानक त्रुटियों की रिपोर्ट करें।

--मदद सहायता प्रिंट करें.

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन पैलॉजिस्ट का उपयोग करें