प्रीगैप4 - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

प्रीगैप4 - गैप4 (स्टैडेन का हिस्सा) के साथ उपयोग के लिए अनुक्रमण उपकरणों से कच्चा डेटा तैयार करें
पैकेज)

वर्णन

गैप4 डेटाबेस में प्रवेश से पहले अनुक्रमण उपकरणों से कच्चा डेटा होना आवश्यक है
कई प्रक्रियाओं से गुज़रा, जैसे वैक्टर के लिए स्क्रीनिंग, गुणवत्ता मूल्यांकन, और
डेटा प्रारूपों का रूपांतरण. Pregap4 का उपयोग इनके माध्यम से रीडिंग के एक बैच को पास करने के लिए किया जाता है
स्वचालित तरीके से कदम. यह स्थापित करने और कॉन्फ़िगर करने के लिए एक इंटरफ़ेस प्रदान करता है
प्रसंस्करण और प्रत्येक चरण के माध्यम से रीडिंग के पारित होने को नियंत्रित करने के लिए।
अलग-अलग कार्यों को "मॉड्यूल" कहा जाता है और प्रत्येक मॉड्यूल को आम तौर पर एक समर्पित द्वारा प्रबंधित किया जाता है
कार्यक्रम. Pregap4 इन सभी मॉड्यूल को एक उपयोग में आसान वातावरण में लपेटता है
प्रसंस्करण मॉड्यूल का चयन और विस्तार करने के लिए लचीलापन बनाए रखना। यह एक, जैसा है
अभी तक, कार्यक्रम प्रीगैप का अप्रकाशित प्रतिस्थापन बोनफील्ड, जेके और स्टैडेन, आर।
बड़े पैमाने पर अनुक्रमण परियोजनाओं के दौरान प्रयोग फ़ाइलें और उनका अनुप्रयोग। डीएनए
अनुक्रम 6, 109-117 (1996)।

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