यह कमांड प्रोडिगल है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
प्रोडिगल - माइक्रोबियल (बैक्टीरिया और आर्कियल) जीन खोज कार्यक्रम
SYNOPSIS
खर्चीला [-a ट्रांस_फ़ाइल] [-c] [-d nuc_file] [-f उत्पादन का प्रकार] [-जी tr_table] [-एच] [-आई
इनपुट_फाइल] [-एम] [-एन] [-ओ आउटपुट_फाइल] [-पी मोड] [-क्यू] [-एस स्टार्ट_फाइल] [-टी ट्रेनिंग_फाइल]
[-वी]
वर्णन
प्रोडिगल (प्रोकैरियोटिक डायनेमिक प्रोग्रामिंग जीनफाइंडिंग एल्गोरिदम) एक माइक्रोबियल (जीवाणु) है
और आर्कियाल) जीन खोज कार्यक्रम ओक रिज नेशनल लेबोरेटरी में विकसित किया गया
टेनेसी विश्वविद्यालय।
विकल्प
-a: चयनित फ़ाइल में प्रोटीन अनुवाद लिखें।
-c: बंद सिरे. जीन को किनारे से बहने न दें।
-d: चयनित फ़ाइल में जीन के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम लिखें।
-f: आउटपुट स्वरूप (जीबीके, जीएफएफ, या एससीओ) का चयन करें। डिफ़ॉल्ट जीबीके है.
-g: उपयोग करने के लिए एक अनुवाद तालिका निर्दिष्ट करें (डिफ़ॉल्ट 11)।
-h: सहायता मेनू प्रिंट करें और बाहर निकलें।
-i: इनपुट फ़ाइल निर्दिष्ट करें (डिफ़ॉल्ट stdin से पढ़ता है)।
-m: एन के रन को छिपे हुए अनुक्रम के रूप में मानें और उनमें जीन का निर्माण न करें।
-n: शाइन-डेलगार्नो ट्रेनर को बायपास करें और प्रोग्राम को रूपांकनों को स्कैन करने के लिए बाध्य करें।
-o: आउटपुट फ़ाइल निर्दिष्ट करें (डिफ़ॉल्ट stdout पर लिखता है)।
-p: प्रक्रिया का चयन करें (एकल या मेटा)। डिफ़ॉल्ट एकल है.
-q: चुपचाप चलाएँ (सामान्य stderr आउटपुट दबाएँ)।
-s: चयनित फ़ाइल में सभी संभावित जीन (स्कोर के साथ) लिखें।
-t: एक प्रशिक्षण फ़ाइल लिखें (यदि कोई मौजूद नहीं है); अन्यथा, निर्दिष्ट को पढ़ें और उपयोग करें
प्रशिक्षण फ़ाइल.
-v: संस्करण संख्या प्रिंट करें और बाहर निकलें।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन प्रोडिगल का उपयोग करें
