स्पिन - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

स्पिन - डीएनए संपादन और विश्लेषण उपकरण (स्टेडन पैकेज का हिस्सा)

SYNOPSIS

स्पिन [विकल्प]

वर्णन

स्पिन अनुक्रमों का विश्लेषण और तुलना करने के लिए एक इंटरैक्टिव और ग्राफिकल प्रोग्राम है। यह
इसमें प्रतिबंध साइटों, सर्वसम्मति अनुक्रमों/रूपांकनों और प्रोटीन की खोज करने के कार्य शामिल हैं
कोडिंग क्षेत्र, अनुक्रम की संरचना का विश्लेषण कर सकते हैं और डीएनए को प्रोटीन में अनुवादित कर सकते हैं।
इसमें भीतर और बीच में समानता के खंडों का पता लगाने के कार्य भी शामिल हैं
अनुक्रम, और अनुक्रमों के जोड़े के बीच वैश्विक और स्थानीय संरेखण खोजने के लिए। की मदद
तुलनाओं के सांख्यिकीय महत्व का आकलन करें जिसकी कार्यक्रम तालिकाओं से गणना कर सकता है
प्रत्येक स्कोर स्तर के लिए अपेक्षित और देखी गई स्कोर आवृत्तियाँ। अधिकांश विश्लेषणात्मक कार्य
जो एकल अनुक्रमों पर काम करते हैं, वे अपने ग्राफ़िकल परिणामों को "स्पिन अनुक्रम प्लॉट" में जोड़ते हैं
यह विश्लेषण किए जा रहे अनुक्रम से जुड़ा हुआ है। (एक अपवाद प्रतिबंध है
एंजाइम खोज जो अपनी अलग विंडो बनाती है।) अधिकांश फ़ंक्शन जो जोड़े की तुलना करते हैं
अनुक्रमों के परिणाम उनके परिणामों को "स्पिन अनुक्रम तुलना प्लॉट" में जोड़ते हैं। स्पिन अनुक्रम
प्लॉट और SPIN अनुक्रम तुलना प्लॉट प्रत्येक में संबद्ध अनुक्रम डिस्प्ले विंडो हैं:
अनुक्रम प्रदर्शन और अनुक्रम तुलना प्रदर्शन। ये के पाठ की अनुमति देते हैं
देखे जाने वाले अनुक्रम और संबंधित स्थितियों को दिखाने के लिए कर्सर का उपयोग करें
चित्रमय प्रदर्शन. ग्राफ़िकल प्लॉट को ज़ूम किया जा सकता है, और कर्सर या क्रॉसहेयर को ज़ूम किया जा सकता है
व्यक्तिगत परिणामों की स्थिति का पता लगाने के लिए उपयोग किया जाता है। भूखंडों को अधिरोपित किया जा सकता है।

विकल्प

-रंग मानचित्र: मुख्य विंडो के लिए कलरमैप

-प्रदर्शन:
उपयोग हेतु प्रदर्शित करें

-ज्यामिति: विंडो के लिए प्रारंभिक ज्यामिति

-रतालू:
आवेदन के लिए उपयोग हेतु नाम

-सिंक: डिस्प्ले सर्वर के लिए सिंक्रोनस मोड का उपयोग करें

-दृश्य:
मुख्य विंडो के लिए दृश्य

-उपयोग: विंडो की आईडी जिसमें एप्लिकेशन एम्बेड करना है

--: शेष सभी तर्कों को स्क्रिप्ट से गुजारें

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