झांवा

कार्यक्रम:

नाम

पाइमोल - मुक्त और लचीला आणविक ग्राफिक्स और मॉडलिंग पैकेज

SYNOPSIS

झांवा [विकल्पों] [फ़ाइलों]

वर्णन

इन वर्षों में, PyMOL एनिमेशन के समर्थन के साथ एक सक्षम आणविक दर्शक बन गया है,
उच्च गुणवत्ता वाले प्रतिपादन, क्रिस्टलोग्राफी, और अन्य सामान्य आणविक ग्राफिक्स गतिविधियां।
इसे कई सैकड़ों (शायद हजारों) वैज्ञानिकों ने भी अपनाया है
तीस देश। हालांकि, विकास के साथ, PyMOL अभी भी बहुत काम प्रगति पर है
आने वाले वर्षों तक जारी रहने की उम्मीद है।

विकल्प

ये विकल्प वर्तमान में समर्थित हैं:

-2 दो-बटन माउस मोड में प्रारंभ करें।

-c कमांड लाइन मोड, कोई GUI नहीं। बैच संचालन के लिए।

-d स्ट्रिंग
स्टार्टअप पर pymol कमांड स्ट्रिंग चलाएँ।

-e फ़ुल-स्क्रीन मोड में प्रारंभ करें।

-f #रेखा
ओपनजीएल में कमांड और फीडबैक के प्रदर्शन को नियंत्रित करता है (0=बंद).

-g फ़ाइल.पीएनजी
PNG फ़ाइल लिखें (पिछले तर्कों का मूल्यांकन करने के बाद)

-i आंतरिक ओपनजीएल जीयूआई (ऑब्जेक्ट सूची, मेनू, आदि) को अक्षम करें

-l फ़ाइल.py
नए धागे में एक पायथन प्रोग्राम स्पॉन करें।

-o सत्र फ़ाइलों के लिए सुरक्षा सुरक्षा अक्षम करें।

-p मानक इनपुट पर आदेशों को सुनें।

-q शांत प्रक्षेपण। स्प्लैश स्क्रीन और अन्य बकवास को दबाएं।

-r फ़ाइल.py
एक पायथन प्रोग्राम चलाएँ (in __मुख्य__) शुरुआत में।

-s लिपि
इस PyMOL स्क्रिप्ट या प्रोग्राम फ़ाइल में कमांड को सेव करें।

-t Tcl/Tk आधारित बाहरी GUI मॉड्यूल का उपयोग करें (पीएमजी_टीके).

-u लिपि
इस PyMOL स्क्रिप्ट या प्रोग्राम फ़ाइल को लोड और संलग्न करें।

-x बाहरी GUI मॉड्यूल को अक्षम करें।

-B ब्लू-लाइन स्टीरियो सिग्नल सक्षम करें (मैक स्टीरियो के लिए)

-G गेम मोड में शुरू करें।

-M हार्डवेयर स्टीरियो मौजूद होने पर भी मोनो को फ़ोर्स करें।

-R ग्रेग लैंड्रम का XMLRPC श्रोता लॉन्च करें।

-S यदि संभव हो तो स्टीरियो में फोर्स और लॉन्च करें।

-X int -Y int -W int -H int -V int
विंडो ज्यामिति समायोजित करें।

सब फ़ाइलों बशर्ते PyMOL शुरू होने के बाद लोड या चलाया जाएगा। उनके पास इनमें से एक हो सकता है
निम्नलिखित एक्सटेंशन:

स्टार्टअप पर चलाने के लिए .pml PyMOL कमांड स्क्रिप्ट
.py[cm] पायथन प्रोग्राम स्टार्टअप पर चलाया जाएगा
.pdb प्रोटीन डेटा बैंक प्रारूप फ़ाइल स्टार्टअप पर लोड की जाएगी
.mmod मैक्रोमॉडल प्रारूप स्टार्टअप पर लोड किया जाएगा
.mol MDL MOL फ़ाइल स्टार्टअप पर लोड की जाएगी
.sdf एमडीएल एसडी फाइल को स्टार्टअप पर पार्स और लोड किया जाना है
.xplor X-PLOR मैप फ़ाइल (ASCII) स्टार्टअप पर लोड की जाएगी
.ccp4 CCP4 मैप फ़ाइल (BINARY) स्टार्टअप पर लोड की जाएगी
.cc[12] केमड्रा 3डी कार्टेशियन कोऑर्डिनेट फाइल
.pkl मसालेदार केमपी मॉडल (वर्ग "chempy.model.indexed")
.r3d Raster3D फ़ाइल
.cex सीईएक्स फ़ाइल (रूपक)
.शीर्ष एम्बर टोपोलॉजी फ़ाइल
.crd एम्बर समन्वय फ़ाइल
.rst एम्बर फ़ाइल पुनरारंभ करें
.trj एम्बर प्रक्षेपवक्र
.pse PyMOL सत्र फ़ाइल
.फी डेल्फी/समझ इलेक्ट्रोस्टैटिक संभावित मानचित्र

विकल्पों की सूची के लिए, आप निम्न की कमांड लाइन में भी दर्ज कर सकते हैं झांवा:

मदद शुरू करने

कमानों

कृपया PyMols ऑनलाइन दस्तावेज़ देखें
http://www.pymolwiki.org/index.php/Category:कमांड या कमांड के लिए इसकी आंतरिक मदद
संदर्भ।

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन पाइमोल का उपयोग करें