Ini adalah demux perintah yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
demux - Konversi pembatasan jarak XPLOR ke format Gromacs
RINGKASAN
demux md0.log tambahan
DESKRIPSI
Jika Anda ingin membuat lintasan Anda terus menerus lagi, Anda dapat menggunakan demux untuk membaca
file md0.log Anda (Anda dapat menggabungkan beberapa jika perlu) dan menghasilkan beberapa output
file. Salah satunya adalah file .xvg (replika_ndx.xvg) yang dapat diteruskan ke trjcat(1) sepanjang
dengan file lintasan asli, untuk menghasilkan lintasan yang berkelanjutan. Yang lain
berkas (replika_temp.xvg) berisi suhu untuk setiap replika, mulai dari
suhu asli. Jadi, jika replika minat Anda dimulai pada, katakanlah, 300 K, Anda dapat mengikuti
lintasannya melalui ruang suhu. Akan menarik untuk menambahkan beberapa
fungsionalitas untuk membuat histogram distribusi suhu untuk setiap replika, yang
menurut kebanyakan penulis, harus datar. Lintasan demuxed dapat digunakan dengan
g_kinetik(1) untuk mendapatkan kinetika pelipatan protein dari lintasan REMD.
PILIHAN
md0.log File log dari lintasan yang ingin Anda buat terus menerus. Beberapa file dapat
ditambahkan bersama-sama.
tambahan Berapa kali setiap entri dalam file log akan disalin. (Bilangan bulat)
PEMBATASAN
Jika pertukaran Anda setiap N ps dan Anda menyimpan setiap M ps, Anda dapat membuat yang hilang
bingkai dengan pengaturan tambahan ke (N/M - 1). Jika N/M bukan bilangan bulat, Anda kurang beruntung dan Anda
tidak akan dapat menghilangkan lintasan Anda sama sekali.
Gunakan demux online menggunakan layanan onworks.net
