Ini adalah perintah fpromlke yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
fpromlk - Filogeni protein dengan kemungkinan maksimum
RINGKASAN
fromlk -urutan seqsetall -intreefile pohon [-nkategori bilangan bulat] -menilai susunan
-kategori properties [-bobot properties] -panjang boolean [-model daftar]
[-gamma daftar] -gamakoefisien mengapung -ngammacat bilangan bulat -invarkoefisien mengapung
-ninvarcat bilangan bulat -invarfrac mengapung -nhmmkategori bilangan bulat -hmmrate susunan
-hmmprobabilitas susunan -situs penyesuaian boolean -lambda mengapung -mengacak-acak bilangan bulat
-benih bilangan bulat -global boolean [-keluar bilangan bulat] -file keluar file keluar [-ikan trout toggle]
-file pohon luar file keluar [-data cetak boolean] [-kemajuan boolean] [-cetak pohon boolean]
[-hipstat boolean]
fromlk -bantu
DESKRIPSI
fromlk adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Filogeni: Urutan Molekuler".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan seqsetall
File yang berisi satu atau lebih perataan urutan
-intreefile pohon
-nkategori bilangan bulat
Nilai default: 1
-menilai susunan
-kategori properties
-bobot properties
Tambahan bagian
-panjang boolean
Nilai default: N
-model daftar
Nilai default: Jones-Taylor-Thornton
-gamma daftar
Nilai default: n
-gamakoefisien mengapung
Nilai default: 1
-ngammacat bilangan bulat
Nilai default: 1
-invarkoefisien mengapung
Nilai default: 1
-ninvarcat bilangan bulat
Nilai default: 1
-invarfrac mengapung
Nilai default: 0.0
-nhmmkategori bilangan bulat
Nilai default: 1
-hmmrate susunan
Nilai default: 1.0
-hmmprobabilitas susunan
Nilai default: 1.0
-situs penyesuaian boolean
Nilai default: N
-lambda mengapung
Nilai default: 1.0
-mengacak-acak bilangan bulat
-benih bilangan bulat
Nilai default: 1
-global boolean
Nilai default: N
-keluar bilangan bulat
Keluaran bagian
-file keluar file keluar
-ikan trout toggle
Nilai default: Y
-file pohon luar file keluar
-data cetak boolean
Nilai default: N
-kemajuan boolean
Nilai default: Y
-cetak pohon boolean
Nilai default: Y
-hipstat boolean
Nilai default: N
Gunakan fpromlke online menggunakan layanan onworks.net