Ini adalah command gap5 yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
gap5 - Program Perakitan Genom (bagian dari paket staden)
RINGKASAN
celah5 [-ro] [-maxseq ] [-maksdb ] [-lewati_catatan] [DATABASE_NAME.V]
DESKRIPSI
Gap5 adalah Program Perakitan Genom. Program ini berisi semua alat yang akan
diharapkan dari program perakitan ditambah banyak fitur unik dan sangat mudah digunakan
antarmuka. Versi aslinya dijelaskan dalam Bonfield,JK, Smith,KF dan Staden,R. A
program perakitan urutan DNA baru. Asam Nukleat Res. 24, 4992-4999 (1995)
Gap5 sangat besar dan kuat. Setiap orang menggunakan subset pilihan dan memiliki
cara favorit untuk mengakses dan menggunakannya. Meskipun ada banyak, pengguna
didorong untuk membaca seluruh dokumentasi sekali, hanya untuk menemukan apa itu
mungkin, dan cara yang paling sesuai dengan pekerjaan mereka sendiri. Setidaknya, seluruh ini
bab pengantar harus dibaca, karena dalam jangka panjang, itu akan menghemat waktu.
PILIHAN
-ro Read-only
-maxseq N
Panjang konsensus total maksimum awal
-maksdb N
Jumlah maksimum awal contigs + bacaan
-(tidak_)cek
(Jangan) jalankan Periksa Database saat DB terbuka
-(tidak_)catatan_exec
(Jangan) jalankan catatan OPEN/CLOS saat database terbuka
-(tidak_)data_catatan mentah
(Jangan) gunakan catatan RAWD alih-alih RAWDATA env. variabel
-(tidak_)csel
(Jangan) memulai pemilih contig setelah db terbuka
-tampilan
Tampilan X untuk digunakan
-ukuran bit N
Menentukan bitsize file aux untuk database baru (32/64)
-sync Gunakan mode sinkron untuk server tampilan (debugging)
-- Akhir dari daftar argumen
Gunakan gap5 online menggunakan layanan onworks.net
