miconv - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

miconv - Mengonversi data gambar medis antar format.

RINGKASAN

mikonv [Pilihan] []

DESKRIPSI

miconv: Mengonversi data citra medis antar format.

Format file secara otomatis diidentifikasi oleh ekstensi file mereka. Ia mengharapkan pada
setidaknya dua nama file/direktori (untuk file input dan output) di akhir
garis komando. Pengecualian adalah opsi '-l' yang hanya membutuhkan satu
nama file/direktori untuk mencantumkan kontennya.

Umum pilihan:
-l: Mencantumkan set parameter protokol dan keluar yang dipisahkan oleh spasi. Gunakan '-l help' untuk mendapatkan
daftar parameter yang mungkin dan '-l all' untuk mencantumkan semua parameter. Parameternya
'output-file' harus dihilangkan saat menggunakan opsi ini.

-p: Muat protokol ini untuk default

Protokol pilihan:
-tanggal: Tanggal pemindaian [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)

-fp: FOV dalam arah fase [mm] (default=220.0mm)

-NS: FOV dalam arah baca [mm] (default=220.0mm)

-fs: FOV dalam arah irisan [mm] (default=5.0mm)

-nr: Jumlah pengukuran berurutan (default=1)

-nx: Jumlah titik dalam arah baca (default=128)

-ny: Jumlah titik dalam arah fase (default=128)

-nz: Jumlah titik dalam arah irisan (default=1)

-kelahiran: Tanggal lahir pasien [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)

-pid: Pengidentifikasi pasien unik (default=Tidak diketahui)

-nama: Nama lengkap pasien (default=Tidak diketahui)

-pseks: Jenis kelamin pasien (opsi=MFO , default=O)

-berat: Berat badan pasien [kg] (default=50.0kg)

-ilmu: Nama Ilmuwan (default=Tidak Diketahui)

-sd: Jarak antar-irisan (dari pusat ke tengah) [mm] (default=10.0mm)

-serd: Deskripsi Seri (default=Tidak diketahui)

-serno: Nomor Seri (default=1)

-NS: Ketebalan irisan [mm] (default=5.0mm)

-pejantan: Deskripsi Studi (default=Tidak diketahui)

-namatc: Nama koil transmisi (default=Tidak diketahui)

-teh: Time-to-echo dari urutan [ms] (default=80.0ms)

-waktu: Waktu pemindaian [hhmmss] (default=091009hhmmss)

-tr: Waktu antara eksitasi berturut-turut [ms] (default=1000.0ms)

File Baca baca pilihan:
-cplx: Perlakukan data sebagai kompleks dan ekstrak komponen yang diberikan (opsi=none abs pha real
gambar , default=tidak ada)

-ds: Indeks kumpulan data untuk diekstraksi jika beberapa kumpulan data dibaca

-Saring: Hanya baca kumpulan data yang parameter protokolnya 'kunci' berisi string
'nilai' (diberikan dalam format 'kunci=nilai')

-fmap: Untuk mengurangi penggunaan memori, simpan pemetaan file setelah membaca data (mentah), tetapi menulis
ke dalam array akan mengakibatkan crash

-jdx: Jika ada beberapa array JDX, pilih ini

-dialek: Membaca data menggunakan format dialek yang diberikan. (default adalah tidak ada dialek)

-rf: Baca format, gunakan untuk mengganti ekstensi file (opsi = autodetect 3db analy asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=deteksi otomatis)

-melewati: Lewati jumlah byte ini sebelum membaca data mentah (default=0)

File menulis pilihan:
-menambahkan: Tambahkan ke file yang ada, hanya untuk data mentah

-namapara: Daftar parameter protokol yang dipisahkan oleh spasi untuk disertakan saat membuat unik
nama file

-tanpa skala: Jangan mengubah skala nilai saat menyimpan bilangan bulat

-membagi: Memaksa pemisahan pasangan protokol-data menjadi file terpisah.

-Jenis: Jenis representasi gambar (opsi = float otomatis double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit , default=otomatis)

-wdialek: Menulis data menggunakan format dialek yang diberikan. (default adalah tidak ada dialek)

-wf: Format tulis, gunakan untuk mengganti ekstensi file (opsi = autodetect 3db analy asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , default=deteksi otomatis)

-wp: Simpan protokol secara terpisah ke file ini.

filter:
-meluruskan : Sejajarkan data dengan geometri (lokasi voxel) dari
file eksternal

-topeng otomatis : Buat topeng menggunakan ambang batas berbasis histogram otomatis

-gugus : Buat cluster voxel yang berdekatan/berikutnya bukan nol, diurutkan berdasarkan ukuran

-membelit <kernel konvolusi (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ),diameter kernel [mm]> : Konvolusi dalam dimensi spasial

-detren <Jumlah komponen frekuensi rendah yang harus dihilangkan, rata-rata hasil nol
timecourse> : Hapus penyimpangan lambat dari waktu ke waktu

-edit <String posisi/rentang dalam format (jangka waktu,slicepos,phasepos,readpos),nilai baru
of voxel> : Mengedit nilai voxel tunggal

-topeng gen : Buat topeng termasuk semua voxel dengan nilai
dalam kisaran tertentu

-isotrop : membuat gambar voxel isotrop melalui interpolasi (gambar
geometri tidak akan berubah)

-jalan rendah : Pemfilteran lowpass

-maks : Klip semua nilai di atas nilai maksimum

-maksimum : Lakukan proyeksi intensitas maksimum
atas arah yang diberikan

-menggabungkan : Gabungkan kumpulan data menjadi satu kumpulan data dengan memperluas dimensi waktu

-min : Klip semua nilai di bawah nilai minimum

-minip : Lakukan proyeksi intensitas minimum
atas arah yang diberikan

-tidakNaN : Mengganti setiap NaN dengan nilai yang diberikan

-pflip : Membalik data dalam arah fase

-prank : Pilih rentang di
arah fase

-proyek : Lakukan proyeksi rata-rata di atas yang diberikan
arah

-kuantilmask : Buat topeng termasuk semua voxel di atas pecahan yang diberikan
ambang

-sampel : Mengubah ukuran sementara data gambar

-ukuran : Mengubah ukuran spasial data gambar

- potong ulang : mengiris gambar ke yang diberikan
orientasi

-rflip : Membalik data ke arah baca

-membusuk : Rotasi dalam pesawat

-mengatur : Pilih rentang di
baca arah

-skala : Skala ulang nilai gambar

-slip : Membalik data ke arah irisan

-bergeser <bacaPergeseran arah [piksel],pergeseran arah fase [piksel],pergeseran arah irisan
[piksel]> : Menggeser data secara spasial

-waktu potong : Benar untuk
titik waktu akuisisi yang berbeda dari irisan

-sambatan : menyambungkan
gambar ke arah yang diberikan

-aneh : Pilih rentang di
arah irisan

-tukardim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : menukar/mencerminkan dimensi dengan menentukan arah
rangkap tiga dengan tanda refleksi opsional ditambahkan

-ubin : Gabungkan irisan menjadi gambar 2D persegi

-aneh : Pilih rentang di
arah waktu

-bergeser : Pergeseran data tepat waktu

-tipemaks : Klip semua nilai di atas maksimum tipe data tertentu

-ketik : Klip semua nilai di bawah minimum dari tipe data tertentu

-pakaimask : Buat dataset 1D termasuk semua nilai dalam topeng dari file

Lainnya pilihan:
-v atau untuk men-debug/menelusuri semua komponen atau satu
komponen, masing-masing. Nilai yang mungkin untuk loglevel adalah: 0(noLog), 1(errorLog),
2(Log peringatan), 3(Log info).

-h, --membantu, -bantu, --Versi: kapan : Cetak teks bantuan atau informasi versi

Didukung fillet ekstensi (format):
3db (data biner Iris3D)

menganalisa
(NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

asc (ASCII, dialek: tcourse )

coi (set data JCAMP-DX)

dat (Matlab ascii matriks data 2D)

dcm (DICOM, dialek: siemens )

ganda (data mentah ganda)

float (mengambang data mentah)

gz (wadah GNU-Zip untuk format lain)

hdr (Interfile, dialek: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALISIS, dialek: fsl )

idx (indeks 3D bukan nol di ASCII)

ima (DICOM, dialek: siemens )

interfile
(Interfile, dialek: neurostat )

jdx (format gambar JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialek: siemens )

mhd (MetaGambar)

nii (NIFTI/ANALISIS, dialek: fsl )

ph (DICOM, dialek: siemens )

png (Grafik Jaringan Portabel)

pos (posisi xy bukan nol di ASCII)

pro (protokol pengukuran ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (data mentah 16 bit yang ditandatangani)

s32bit (data mentah 32 bit yang ditandatangani)

s8bit (data mentah 8 bit yang ditandatangani)

smp (set data JCAMP-DX)

u16bit (data mentah 16 bit tanpa tanda tangan)

u32bit (data mentah 32 bit tanpa tanda tangan)

u8bit (data mentah 8 bit tanpa tanda tangan)

Gunakan miconv online menggunakan layanan onworks.net