nipy_tsdiffana - Daring di Awan

PROGRAM:

NAMA

nipy_tsdiffana - Analisis, plot metrik perbedaan deret waktu

DESKRIPSI

penggunaan: nipy_tsdiffana [-h] [--out-file OUT_FILE] [--tulis-hasil]

[--jalur keluar OUT_PATH]
[--keluar-fname-label OUT_FNAME_LABEL] [--sumbu-waktu TIME_AXIS] [--sumbu-slice
SLICE_AXIS] nama file

Analisis, plot metrik perbedaan deret waktu

posisi argumen:
nama file
Nama file gambar 4D

opsional argumen:
-h, --membantu
tunjukkan pesan bantuan ini dan keluar

--keluar-file KELUAR_FILE
file grafik untuk menulis alih-alih meninggalkan gambar di layar

--tulis-hasil
jika ditentukan, tulis gambar diagnostik dan variabel analisis, plot ke OUT_PATH.
Saling tidak kompatibel dengan OUT_FILE

--jalan keluar KELUAR_PATH
jalur untuk file gambar keluaran (default dari jalur FILENAME

--keluar-nama-label KELUAR_FNAME_LABEL
bagian tengah gambar keluaran / nama file plot

--waktu-sumbu WAKTU_Sumbu
Sumbu gambar untuk waktu

--slice-sumbu SLICE_AXIS
Sumbu gambar untuk irisan

nipy_tsdiffana menjalankan algoritme perbedaan deret waktu pada volume gambar 4D, sering kali dan
volume FMRI.

Ia bekerja dalam salah satu dari tiga mode:

* interaktif : plot perbedaan deret waktu muncul di layar. Ini adalah

mode default

* non-interaktif, hanya plot: tulis plot perbedaan deret waktu ke grafik

mengajukan. Gunakan "--out-file= " opsi untuk mengaktifkan mode ini

* non-interaktif, tulis plot, gambar dan variabel: tulis plot ke file, dan

tulis juga gambar dan variabel diagnostik yang dihasilkan ke file. Menggunakan
Tandai "--write-results" untuk mengaktifkan opsi ini. Nama file yang dihasilkan berasal dari
hasil opsi "--out-path" dan "--out-fname-label" (lihat bantuan).

Opsi tulis-hasil, file yang dihasilkan -------------------------------------

Saat melakukan analisis titik waktu, kami akan membuat perbedaan volume antara setiap waktu
titik dan titik waktu berikutnya dalam seri. Jika kita memiliki volume T maka akan ada
(T-1) perbedaan volume. Sebut vektor perbedaan volume DV dan yang pertama
perbedaan volume DV[0]. Jadi DV[0] dihasilkan dari pengurangan volume kedua dalam 4D
masukan gambar dari volume pertama dalam gambar masukan 4D. Nilai kuadrat berdasarkan elemen
dari DV[0] adalah *DV2[0]*.

Gambar berikut akan dihasilkan. adalah ekstensi nama file input (mis
'.nii'):

* "dv2_max_ " : Volume gambar 3D, di mana setiap irisan S berasal dari irisan

semua DV2[0] (irisan S) melalui DV2[T-1] (irisan S) yang memiliki penjumlahan maksimum
nilai kuadrat. Volume ini memberikan gambaran tentang irisan terburuk (perbedaan tertinggi)
di seluruh rangkaian waktu.

* "dv2_mean_ " : rata-rata semua volume DV2 DV2[0] .. DV[T-1]

melintasi dimensi volume (waktu).
Nilai voxel yang lebih tinggi dalam volume ini berarti

bahwa perbedaan titik waktu ke titik waktu cenderung tinggi dalam voxel ini.

Kami juga menulis sinyal rata-rata pada setiap titik waktu, dan perbedaan kuadrat rata-rata antara
setiap irisan dalam waktu, sebagai variabel ke file 'npz' bernama "tsdiff_ .npz"

Nama file untuk output berbentuk /
di mana adalah jalur yang ditentukan oleh --jalan keluar opsi, atau jalur input
nama file; adalah salah satu awalan standar di atas, diberikan oleh
--label keluar, atau dengan nama file gambar input (dengan jalur dan ekstensi dihapus), dan
adalah '.png' untuk grafik, atau ekstensi nama file input untuk volume
gambar-gambar. Misalnya, hanya menentukan nama file input ``/some/path/fname.img`` akan
menghasilkan nama file dalam bentuk ``/some/path/tsdiff_fname.png,
/some/path/dv2_max_fname.img`` dll.

Gunakan nipy_tsdiffana online menggunakan layanan onworks.net