Ini adalah perintah ntthal yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
ntthal - Menyediakan fungsionalitas penyelarasan Primer3 berdasarkan tetangga terdekat
pendekatan termodinamika
DESKRIPSI
tidak analog dengan ntdpal. Di antara dua urutan, tidak menemukan keselarasan/dtk
struktur, yang memiliki suhu leleh tertinggi. Ntthal didasarkan pada tetangga terdekat
pendekatan termodinamika.
RINGKASAN
tidak PILIHAN oligo
PILIHAN
-mv monovalent_conc - konsentrasi kation monovalen dalam mM, secara default 50 mM
-dv divalent_conc - konsentrasi kation divalen dalam mM, secara default 0 mM
-n dNTP_conc - konsentrasi deoxynycleotide triphosphate dalam mM, secara default 0
mM
-d dna_conc - konsentrasi untai DNA dalam nM, secara default 50 nM
-a mode - tipe penyelarasan, END1, END2, ANY dan HAIRPIN, secara default APAPUN (bila
rangkap)
-t temp - suhu di mana dupleks dihitung, secara default 37C
-r - menyebabkan keselarasan TIDAK ditampilkan di stderr, _only_ Tm adalah
напечатанный
-loop maksimal size - ukuran maksimum loop struktur sekunder.
Standarnya adalah 30 (ini adalah panjang maksimum yang diizinkan, saat ini).
-jalan - jalur ke file parameter termodinamika
-S1 DNA_oligomer
-S2 DNA_oligomer
PENULIS
Halaman manual ini dibuat oleh Andreas Tille[email dilindungi]> menggunakan help2man untuk Debian
tetapi dapat digunakan secara bebas untuk tujuan lain apa pun
Gunakan ntthal online menggunakan layanan onworks.net
