Ini adalah perintah yang hilang yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
prodigal - program pencarian gen mikroba (bakteri dan archaeal)
RINGKASAN
boros [-a trans_file] [-c] [-d nuc_file] [-f keluaran_tipe] [-g tr_tabel] [-h] [-i
file_masukan] [-m] [-n] [-o file_keluaran] [-mode p] [-q] [-s file_mulai] [-t file_pelatihan]
[-v]
DESKRIPSI
Prodigal (Prokariotik Dynamic Programming Genefinding Algorithm) adalah mikroba (bakteri)
dan archaeal) program penemuan gen yang dikembangkan di Laboratorium Nasional Oak Ridge dan
Universitas Tennessee.
PILIHAN
-a: Tulis terjemahan protein ke file yang dipilih.
-c: Ujung tertutup. Jangan biarkan gen melenceng.
-d: Tulis urutan nukleotida gen ke file yang dipilih.
-f: Pilih format keluaran (gbk, gff, atau sco). Standarnya adalah gbk.
-g: Menentukan tabel terjemahan yang akan digunakan (default 11).
-h: Cetak menu bantuan dan keluar.
-i: Tentukan file input (default membaca dari stdin).
-m: Perlakukan run of n sebagai urutan bertopeng dan jangan membangun gen di atasnya.
-n: Lewati pelatih Shine-Dalgarno dan paksa program untuk memindai motif.
-o: Tentukan file output (menulis default ke stdout).
-p: Pilih prosedur (tunggal atau meta). Standarnya adalah tunggal.
-q: Jalankan dengan tenang (menekan output stderr normal).
-s: Tulis semua gen potensial (dengan skor) ke file yang dipilih.
-t: Tulis file pelatihan (jika tidak ada); jika tidak, baca dan gunakan yang ditentukan
berkas pelatihan.
-v: Cetak nomor versi dan keluar.
Gunakan online yang hilang menggunakan layanan onworks.net