Ini adalah propka perintah yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
propka - Protonasi file PDB berdasarkan pKa
RINGKASAN
propka PROPKATMP1
DESKRIPSI
propka mengotomatiskan protonasi (penempatan ion hidrogen) ke struktur di PDB
format untuk setiap nilai pKa yang diberikan. File yang akan digunakan harus diberi nama PROPKATMP1 di
direktori tempat propka dijalankan.
propka akan menghasilkan dua file output bernama PROPKATMP2 dan PROPKATMP3. PROPKATMP2
berisi struktur yang dihasilkan dalam format PDB. PROPKATMP3 berisi ringkasan tentang
propka menjalankan.
MENGUTI PROPKA
Harap akui penggunaan Anda atas propka dengan mengutip:
Hui Li, Andrew D. Robertson, dan Jan H. Jensen: Prediksi Empiris Sangat Cepat dan
Interpretasi Nilai pKa Protein, Protein, 2005, 61, 704-721.
WEB LAYANAN
PropKa dapat digunakan melalui antarmuka web di http://propka.ki.ku.dk/.
Gunakan propka online menggunakan layanan onworks.net
