Ini adalah perintah Psequin yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
Psequin - kirim urutan ke Genbank, EMBL, dan DDBJ
RINGKASAN
payet [-b] [-bse] [-e] [-f nama file] [-gc] [-h] [-lama] [-lama] [-tuagph] [-seq lama]
[-sumber lama] [-s] [-w] [-x]
DESKRIPSI
payet adalah program yang dirancang untuk membantu pengiriman urutan ke GenBank, EMBL,
dan database urutan DDBJ. Itu ditulis di Pusat Nasional untuk Bioteknologi
Informasi, bagian dari National Library of Medicine di National Institutes of
Kesehatan.
payet dapat mengumpulkan elemen penting dari catatan GenBank dari format FASTA sederhana
file teks. Misalnya, program memperoleh kode genetik yang tepat dari suatu organisme
nama, dan secara otomatis menentukan interval wilayah pengkodean dengan terjemahan balik dari
urutan protein. Jendela bantuan online bergulir ke tempat yang sesuai sebagai pengguna
bergerak di antara dan di dalam formulir entri data, memberikan detail yang relevan tentang informasi apa itu
diharapkan.
payet juga berisi sejumlah fungsi validasi bawaan untuk jaminan kualitas.
Fitur seperti situs sambungan dan terjemahan wilayah pengkodean diperiksa keakuratannya atau
konsistensi internal. Mengklik dua kali pada pesan kesalahan meluncurkan editor yang sesuai
dimana pengguna dapat memperbaiki masalah.
payet memberikan tampilan data yang langsung dan dapat diklik dalam berbagai format, termasuk a
formulir laporan, flatfile GenBank, flatfile EMBL, dan tampilan grafis. Klik dua kali pada sebuah
item dalam salah satu format ini meluncurkan editor untuk item tersebut. Editor mampu
mempertahankan posisi tabel fitur yang benar saat urutan yang mendasarinya diedit. Bisa
menampilkan fitur pada urutan selama pengeditan, dan memungkinkan interval fitur menjadi
disesuaikan dengan manipulasi langsung.
PILIHAN
-b Mode pengaturan Bioseq
-bse modus binseqentry
-e Modus semangat
-f nama file
baca dari nama file
-gc mode pusat genom
-h matikan bantuan otomatis
-lama
gunakan pembaca perataan lama
-lama
tinggalkan ASN.1 yang lama
-tuagph
gunakan tampilan grafis lama
-seq lama
gunakan tampilan urutan lama
-sumber lama
gunakan format sumber file datar lama
-s mode subalat
-w mode meja kerja
-x membaca dari input standar
Gunakan Psequin online menggunakan layanan onworks.net
