Ini adalah perintah show-diff yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
show-diff - tampilkan informasi diff (bagian dari paket mummer)
RINGKASAN
tunjukkan perbedaan [pilihan]
DESKRIPSI
-f Keluarkan informasi perbedaan sebagai fitur AMOS
-h Tampilkan informasi bantuan
-H Jangan tampilkan tajuk
-q Tampilkan informasi perbedaan untuk kueri
-r Tampilkan informasi perbedaan untuk referensi (default)
Menampilkan daftar perbedaan struktural untuk setiap urutan dalam referensi dan kueri,
diurutkan berdasarkan posisi. Untuk urutan referensi R, dan urutan kuerinya yang cocok Q,
perbedaan dikategorikan sebagai GAP (kesenjangan antara dua keberpihakan yang saling konsisten), DUP
(duplikasi disisipkan), BRK (urutan disisipkan lainnya), JMP (penataan ulang), INV
(penataan ulang dengan inversi), SEQ (penataan ulang dengan urutan lain). Lima pertama
kolom output adalah seq ID, tipe fitur, fitur awal, fitur akhir, dan fitur
panjang. Kolom tambahan ditambahkan tergantung pada jenis fitur. Fitur negatif
panjang menunjukkan tumpang tindih blok penyelarasan yang berdekatan.
GAP gap-mulai gap-end gap-length-R gap-length-Q gap-diff
IDR DUP dup-start dup-end dup-panjang
Gap-start gap-end gap-panjang IDR BRK
JMP gap-start gap-end gap-length
Gap-mulai gap-end gap-panjang IDR INV
IDR SEQ gap-start gap-end gap-length sebelumnya-urutan berikutnya
Posisi selalu merujuk urutan dengan ID yang diberikan. Jumlah kolom kelima
(mengabaikan nilai negatif) adalah jumlah total urutan yang disisipkan. Menjumlahkan kelima
kolom setelah menghapus fitur DUP adalah urutan total unik yang dimasukkan. Perhatikan bahwa tidak selaras
urutan tidak dihitung, dan dapat mewakili urutan "unik" tambahan. Lihat
dokumentasi untuk tip tentang cara menafsirkan fitur jeda perataan ini.
Gunakan show-diff online menggunakan layanan onworks.net
