Ini adalah aplikasi Linux bernama Altrans untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai altrans.v1.1.02.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama Altrans ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Altrans untuk dijalankan di Linux online
Ad
DESKRIPSI
Altrans adalah metode untuk kuantifikasi relatif dari peristiwa splicing. Ini membutuhkan file penyelarasan BAM dari eksperimen RNA-seq dan file anotasi dalam format GTF yang merinci lokasi ekson dalam genom. Ini menggunakan pembacaan akhir berpasangan di mana satu pasangan memetakan ke satu ekson dan pasangan lainnya ke ekson yang berbeda dan/atau membaca terpisah yang mencakup persimpangan ekson ekson untuk menghitung "tautan" antara dua ekson. Ketika ada ekson yang tumpang tindih, ini dikelompokkan ke dalam "grup ekson" dan bagian unik dari setiap ekson dalam grup ekson diidentifikasi yang digunakan saat menetapkan pembacaan ke ekson. Jumlah tautan yang dipastikan dari wilayah unik dinormalisasi dengan kemungkinan mengamati tautan seperti itu mengingat distribusi ukuran sisipan yang disebut sebagai cakupan tautan. Akhirnya metrik kuantitatif yang dihasilkan adalah fraksi dari cakupan satu tautan atas jumlah cakupan semua tautan yang dibuat oleh ekson pertama awal.Para penonton
Sains/Penelitian
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/altrans/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
