Ini adalah aplikasi Linux bernama COGsoft untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai COGsoft.04.19.2012.tgz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama COGsoft ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
COGsoft untuk dijalankan di Linux online
Ad
DESKRIPSI
Perangkat lunak untuk membuat Clusters of Orthologous Groups (menampilkan algoritme EdgeSearch baru). Ref terbaru: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010.Fitur
- Deskripsi kekuatan/kelemahan berbagai metode: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV. Metode komputasi untuk inferensi Ortologi Gen. Bioinform Singkat. 2011 Sep;12(5):379-91. Epub 2011 19 Juni. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
- Referensi algoritma: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Algoritme polinomial rendah untuk merakit cluster grup ortologis dari kecocokan terbaik simetris intergenomik. Bioinformatika. 2010 15 Juni;26(12):1481-7. Epub 2010 2 Mei. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
- Ulasan ortolog/COG yang baik/menyeluruh: Koonin EV. Ortolog, paralog, dan genomik evolusioner. Annu Rev Genet. 2005;39:309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
- Kertas COG asli: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ. Perspektif genomik pada keluarga protein. Sains. 1997 24 Okt;278(5338):631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
- Basis data COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV. Basis data COG: alat untuk analisis skala genom fungsi dan evolusi protein. Asam Nukleat Res. 2000 1 Januari;28(1):33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
- Situs web lab Koonin: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
- Situs FTP resmi: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (walaupun saat ini, readme hanya menunjuk ke halaman sourceforge)
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
C + +
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.