Ini adalah aplikasi Linux bernama Meraculous-2D yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai Meraculous-v2.2.6.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama Meraculous-2D dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
SCREENSHOT:
Mercaculous-2D
DESKRIPSI:
----------------------------------------
PENTING: Meraculous-2D telah digantikan oleh assembler HipMer, tersedia di sini: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
-----------------------------------------
Meraculous-2D adalah keseluruhan genome assembler untuk NGS reads (Illumina) yang mampu merakit genom diploid besar dengan persyaratan komputasi sederhana. Fitur termasuk:
- Penghitungan k-mer yang efisien dan traversal grafik deBruijn
- Dua mode penanganan variasi alel diploid
- Scaffolding yang ditingkatkan yang menghasilkan rakitan lebih lengkap tanpa mengurangi akurasi scaffolding.
Perakitan didorong oleh pipa perl yang melakukan fragmentasi data dan penyeimbangan beban, serta pengiriman dan pemantauan beberapa larik tugas pada klaster tipe GE/SLURM atau server multi-inti mandiri.
Naskah yang dikirim:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608
Fitur
- Majelis Genom Eukariotik
- Mode khusus untuk genomesembly tinggi dan rendah heterozigositas
- Eksekusi terdistribusi bawaan
- Operasi ruang k-mer yang efisien
- Penerapan server tunggal dan siap-cluster (siap-AWS)
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Perl, C++
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/meraculous20/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.