Ini adalah aplikasi Linux bernama MIPGen untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai mipgen_v15.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama MIPGen ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
MIPGen untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
Generator Potensi Interaksi MolekulerMIPGEN adalah program python yang akan menghitung grid Potensi Interaksi Molekuler
pada molekul tertentu, yang dapat berupa protein atau senyawa organik kecil (obat).
Outputnya akan menjadi serangkaian grid dengan format DX (*.dx) yang dapat digunakan oleh pengguna
untuk memvisualisasikan menggunakan program visualisasi Molekuler seperti VMD, PyMol, Chimera...
Untuk informasi lebih lanjut tentang dependensi dan penggunaan, silakan baca Dokumentasi.
Pengguna dipersilakan untuk memposting bug atau permintaan apa pun di bawah menu BUGS & REQUESTS. (akun sourceforge akan dibutuhkan).
Fitur
- Generasi MIP sepenuhnya otomatis diberikan file PDB sederhana.
- Kode sumber terbuka. Pengguna dipersilakan untuk berkontribusi memperluas probe atau meningkatkan kode.
- Hitung potensi interaksi molekuler berbasis grid pada peptida dan sistem makromolekul lainnya (mungkin masih lambat untuk sistem besar)
- Hitung MIP melalui molekul kecil
- Probe yang dapat disesuaikan. Sudah diimplementasikan: Hidrofobik, donor H-Bond, akseptor H-Bond dan probe elektrostatik.
- Penetapan otomatis jenis atom ke molekul kecil dan protein dengan berinteraksi dengan Antechamber opensource dan tLeap dari paket AmbertTools (http://ambermd.org)
Para penonton
Sains/Penelitian, Pengguna Akhir Tingkat Lanjut, Pengembang, Pengguna Akhir/Desktop
User interface
Konsol/Terminal
Bahasa Pemrograman
Ular sanca
Lingkungan Basis Data
SQLite
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/mipgen/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
