Ini adalah aplikasi Linux bernama ParaSim yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai parasim-v0.05.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama ParaSim dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
SCREENSHOT:
ParaSim
DESKRIPSI:
Penilaian keragaman dan perbandingan database senyawa besar memerlukan penghitungan kesamaan jutaan senyawa dalam waktu yang terjangkau. ParaSim mengatasi tantangan ini dengan memparalelkan perhitungan sesuai dengan jumlah inti komputasi yang tersedia pada satu mesin. Ini dioptimalkan untuk throughput sejumlah besar struktur kueri terhadap sejumlah besar struktur referensi. Sebagai fitur khusus, ParaSim memungkinkan untuk menyimpan dan dan mengakses kumpulan data yang sering ditanyakan sebagai objek persisten dalam memori untuk waktu respons yang singkat.
ParaSim menghitung kesamaan kimia berdasarkan sidik jari struktural biner. Itu tidak menghitung sidik jari dengan sendirinya tetapi bergantung pada perangkat lunak pihak ketiga untuk melakukannya. Pada dasarnya, semua jenis sidik jari struktural yang dapat disimpan dalam array bit (bitset) dapat digunakan oleh ParaSim.
Lihat Wiki (https://sourceforge.net/p/parasim/wiki/Documentation/) untuk dokumentasi rinci.
UMPAN BALIK SANGAT DIHARGAI!
Fitur
- Memanfaatkan beberapa inti komputasi
- Dapat menyimpan dan mengakses sidik jari secara terus-menerus dalam memori
- Hasil yang dilaporkan: ID molekul kueri, ID molekul referensi, koefisien kesamaan dan, opsional, data tambahan seperti string Smiles/InChi-Key/Chime dll.
- Memungkinkan jumlah klik yang ditentukan pengguna per kueri dan ambang kesamaan
- Memungkinkan ukuran bitset sidik jari yang berbeda
- Memberikan informasi kemajuan terperinci berdasarkan permintaan
- Tidak diperlukan instalasi
- Membaca sidik jari sebagai bitset berenkode Base64 dari file .txt atau .txt.gz
- Aplikasi demo untuk RDKit, PipelinePilot(TM) dan Knime disertakan
- Script disertakan untuk mencari langsung dari file SDF atau Smiles
Para penonton
Pengembang, Pengguna Akhir/Desktop, Penguji, Sains/Penelitian
User interface
Baris perintah, Konsol/Terminal
Bahasa Pemrograman
C, Perl, Phyton
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/parasim/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.